Anders Krogh

Anders Krogh

Professor

ORCID: 0000-0002-5147-6282

Udgivelsesår:
Alle
1 - 25 ud af 106Pr. side: 25
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2023
  2. Udgivet

    N-of-one differential gene expression without control samples using a deep generative model

    Prada Luengo, Inigo, Schuster, Viktoria, Liang, Yuhu, Terkelsen, Thilde Bagger, Sora, Valentina & Krogh, Anders, 2023, I: Genome Biology. 24, 1, 17 s., 263.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    Synthetic Data Generation by Artificial Intelligence to Accelerate Research and Precision Medicine in Hematology

    D'Amico, S., Dall'Olio, D., Sala, C., Dall'Olio, L., Sauta, E., Zampini, M., Asti, G., Lanino, L., Maggioni, G., Campagna, A., Ubezio, M., Russo, A., Bicchieri, M. E., Riva, E., Tentori, C. A., Travaglino, E., Morandini, P., Savevski, V., Santoro, A., Prada-Luengo, I. & 9 flere, Krogh, Anders, Santini, V., Kordasti, S., Platzbecker, U., Diez-Campelo, M., Fenaux, P., Haferlach, T., Castellani, G. & Della Porta, M. G., 2023, I: JCO clinical cancer informatics. 7, s. 1-22 e2300021.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    The Deep Generative Decoder: MAP estimation of representations improves modelling of single-cell RNA data

    Schuster, Viktoria & Krogh, Anders, 2023, I: Bioinformatics. 39, 9, 14 s., btad497.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. 2022
  6. Udgivet

    Context dependency of nucleotide probabilities and variants in human DNA

    Liang, Yuhu, Grønbæk, Christian, Fariselli, P. & Krogh, Anders, 2022, I: BMC Genomics. 23, 1, 15 s., 87.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Context dependent prediction in DNA sequence using neural networks

    Grønbæk, Christian, Liang, Yuhu, Elliott, Desmond & Krogh, Anders, 2022, I: PeerJ. 10, 22 s., e13666.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. 2021
  9. Udgivet

    A manifold learning perspective on representation learning: Learning decoder and representations without an encoder

    Schuster, Viktoria & Krogh, Anders, nov. 2021, I: Entropy. 23, 11, 14 s., 1403.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    High-throughput proteomics of breast cancer interstitial fluid: identification of tumor subtype-specific serologically relevant biomarkers

    Terkelsen, T., Pernemalm, M., Gromov, P., Borresen-Dale, A., Krogh, Anders, Haakensen, V. D., Lethio, J., Papaleo, E. & Gromova, I., 2021, I: Molecular Oncology. 15, 2, s. 429-461 33 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. 2020
  12. Udgivet

    CAncer bioMarker Prediction Pipeline (CAMPP) - A standardized framework for the analysis of quantitative biological data

    Terkelsen, T., Krogh, Anders & Papaleo, E., 2020, I: PLOS Computational Biology. 16, 3, 20 s., e1007665.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Secreted breast tumor interstitial fluid microRNAs and their target genes are associated with triple-negative breast cancer, tumor grade, and immune infiltration

    Terkelsen, T., Russo, F., Gromov, P., Haakensen, V. D., Brunak, Søren, Gromova, I., Krogh, Anders & Papaleo, E., 2020, I: Breast Cancer Research. 22, 1, 36 s., 73.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Taxonomic classification method for metagenomics based on core protein families with Core-Kaiju

    Tovo, A., Menzel, P., Krogh, Anders, Cosentino Lagomarsino, M. & Suweis, S., 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 16, 13 s., e93.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. 2019
  16. Udgivet

    Sensitive detection of circular DNAs at single-nucleotide resolution using guided realignment of partially aligned reads

    Prada Luengo, Inigo, Krogh, Anders, Sørensen, L. M. & Regenberg, Birgitte, 2019, I: BMC Bioinformatics. 20, 9 s., 663.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. 2018
  18. Udgivet

    Accurate genotyping across variant classes and lengths using variant graphs

    Sibbesen, Jonas Andreas, Maretty, L., Krogh, Anders, Petersen, Bent, Sibbesen, Jonas Andreas, Liu, S., Have, C. T., Bork-Jensen, J., Guo, X., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Wang, J. & Brunak, Søren, 2018, I: Nature Genetics. 50, s. 1054-1059 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Benchmarking the HLA typing performance of Polysolver and Optitype in 50 Danish parental trios

    Matey-Hernandez, M. L., Danish Pan Genome Consortium, D. P. G. C., Brunak, Søren, Izarzugaza, J. M. G., Sørensen, L. M., Petersen, Bent, Sibbesen, Jonas Andreas, Liu, S., Belling, K. G., Have, C. T., Bork-Jensen, J., Sun, J., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Wang, J., Eiberg, Hans Rudolf Lytchoff & Kristiansen, Karsten, 2018, I: BMC Bioinformatics. 19, s. 1-12 239.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Genomic Analyses from Non-invasive Prenatal Testing Reveal Genetic Associations, Patterns of Viral Infections, and Chinese Population History

    Liu, S., Huang, S., Chen, F., Zhao, L., Yuan, Y., Francis, S. S., Fang, L., Li, Z., Lin, L., Liu, R., Zhang, Y., Xu, H., Li, S., Zhou, Y., Davies, R. W., Liu, Q., Walters, R. G., Lin, K., Ju, J., Komeliussen, T. & 18 flere, Yang, M. A., Fu, Q., Wang, J., Zhou, L., Krogh, Anders, Zhang, H., Wang, W., Chen, Z., Cai, Z., Yin, Y., Yang, H., Mao, M., Shendure, J., Wang, J., Albrechtsen, Anders, Jin, X., Nielsen, Rasmus & Xu, X., 2018, I: Cell. 175, 2, s. 347-359, e1-e7

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. 2017
  22. Udgivet

    Sugar metabolism of the first thermophilic Planctomycete Thermogutta terrifontis: comparative genomic and transcriptomic approaches

    Elcheninov, A. G., Menzel, P., Gudbergsdottir, S. R., Slesarev, A. I., Kadnikov, V. V., Krogh, Anders, Bonch-Osmolovskaya, E. A., Peng, Xu & Kublanov, I. V., 2 nov. 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 11 s., 2140.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    Assembly and analysis of 100 full MHC haplotypes from the Danish population

    Jensen, J. M., Villesen, P., Friborg, R. M., Mailund, T., Besenbacher, S., Sørensen, L. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Skov, L., Belling, K. G., Have, C. T., Izarzugaza, J. M. G., Grosjean, M., Bork-Jensen, J., Grove, J., Als, T. D., Huang, S., Chang, Y., Xu, R. & 39 flere, Ye, W., Rao, J., Guo, X., Sun, J., Cao, H., Ye, C., Beusekom, J. V., Espeseth, T., Flindt, E., Halager, A. E., Hellard, S. L., Hultman, C. M., Lescai, F., Li, S., Lund, O., Løngren, P., Matey-Hernandez, M. L., Mors, O., Pedersen, C. N. S., Sicheritz-Pontén, T., Sullivan, P., Syed, A., Westergaard, D., Yadav, R., Li, N., Xu, X., Hansen, Torben, Bolund, L., Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Gupta, R., Rasmussen, Simon, Børglum, A. D., Wang, J., Eiberg, Hans Rudolf Lytchoff, Kristiansen, Karsten, Brunak, Søren & Schierup, M. H., sep. 2017, I: Genome Research. 27, 9, s. 1597-1607 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    Highly accessible AU-rich regions in 3' untranslated regions are hotspots for binding of regulatory factors

    Plass, M., Rasmussen, S. H. & Krogh, Anders, 14 apr. 2017, I: PLoS Computational Biology. 13, 4, 26 s., e1005460.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Analysis of 62 hybrid assembled human Y chromosomes exposes rapid structural changes and high rates of gene conversion

    Skov, L., Schierup, M. H., Danish Pan Genome Consortium, D. P. G. C., Sørensen, L. M., Petersen, Bent, Sibbesen, Jonas Andreas, Liu, S., Belling, K. G., Have, C. T., Bork-Jensen, J., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Rasmussen, Simon, Kristiansen, Karsten & Brunak, Søren, 2017, I: PLOS Genetics. 13, 8, s. e1006834

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Sequencing and de novo assembly of 150 genomes from Denmark as a population reference

    Sørensen, L. M., Jensen, J. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Villesen, P., Skov, L., Belling, K. G., Have, C. T., Izarzugaza, J. M. G., Grosjean, M., Bork-Jensen, J., Grove, J., Als, T. D., Huang, S., Chang, Y., Xu, R., Ye, W., Rao, J., Guo, X. & 39 flere, Sun, J., Cao, H., Ye, C., van Beusekom, J., Espeseth, T., Flindt, E., Friborg, R. M., Halager, A. E., Le Hellard, S., Hultman, C. M., Lescai, F., Li, S., Lund, O., Løngren, P., Mailund, T., Matey-Hernandez, M. L., Mors, O., Pedersen, C. N. S., Sicheritz-Pontén, T., Sullivan, P., Syed, A., Westergaard, David, Yadav, R., Li, N., Xu, X., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Bolund, L., Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Gupta, R., Rasmussen, Simon, Besenbacher, S., Børglum, A. D., Wang, J., Eiberg, Hans Rudolf Lytchoff, Kristiansen, Karsten, Brunak, Søren & Schierup, M. H., 2017, I: Nature. 548, 7665, s. 87-91 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  27. 2016
  28. Udgivet

    Fast and sensitive taxonomic classification for metagenomics with Kaiju

    Menzel, P., Ng, K. L. & Krogh, Anders, 2016, I: Nature Communications. 7, 9 s., 11257.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    Novel viral genomes identified from six metagenomes reveal wide distribution of archaeal viruses and high viral diversity in terrestrial hot springs

    Islin, S. R., Menzel, P., Krogh, Anders, Young, M. & Peng, Xu, 2016, I: Environmental Microbiology. 18, 3, s. 863-874 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    RNA sequencing of trigeminal ganglia in Rattus Norvegicus after glyceryl trinitrate infusion with relevance to migraine

    Pedersen, S. H., Sørensen, L. M., Ramachandran, R., Sibbesen, Jonas Andreas, Yakimov, V., Christensen, R. E., Hansen, Thomas Folkmann, Krogh, Anders, Olesen, Jes & Olesen, I. J., 2016, I: P L o S One. 11, 5, 13 s., e0155039.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. 2015
  32. Udgivet

    De novo assembly of a haplotype-resolved human genome

    Cao, H., Wu, H., Luo, R., Huang, S., Sun, Y., Tong, X., Xie, Y., Liu, B., Yang, H., Zheng, H., Li, J., Li, B., Wang, Y., Yang, F., Sun, P., Liu, S., Gao, P., Huang, H., Sun, J., Chen, D. & 21 flere, He, G., Huang, W., Huang, Z., Li, Y., Tellier, L. C. A. M., Liu, X., Feng, Q., Xu, X., Zhang, X., Bolund, L., Krogh, Anders, Kristiansen, Karsten, Drmanac, R., Drmanac, S., Nielsen, R., Li, S., Wang, J., Yang, H., Li, Y., Wong, G. K. & Wang, J., 2015, I: Nature Biotechnology. 33, 6, s. 617-626 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  33. Udgivet

    Drosophila Imp iCLIP identifies an RNA assemblage coordinating F-actin formation

    Hansen, H. T., Rasmussen, S. H., Adolph, S. K., Plass, M., Krogh, Anders, Sanford, J., Nielsen, Finn Cilius & Christiansen, Jan, 2015, I: Genome Biology (Online Edition). 16, 16 s., 123.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  34. Udgivet

    Cancers of unknown primary origin (CUP) are characterized by chromosomal instability (CIN) compared to metastasis of know origin

    Vikeså, J., Møller, A. K. H., Kaczkowski, B., Helweg-Larsen, R. B., Winther, Ole, Henao Giraldo, R., Krogh, Anders, Perell, K., Jensen, F., Daugaard, G. & Nielsen, Finn Cilius, 2015, I: B M C Cancer. 15, 14 s., 151.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 4 5 Næste

ID: 9738