Sune Darkner
Lektor
Image Analysis, Computational Modelling and Geometry
Universitetsparken 1
2100 København Ø
- Udgivet
cRedAnno+: Annotation Exploitation In Self-Explanatory Lung Nodule Diagnosis
Lu, J., Yin, C., Erleben, Kenny, Nielsen, Michael Bachmann & Darkner, Sune, 2023, 2023 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, ISBI 2023. IEEE Computer Society Press, (Proceedings - International Symposium on Biomedical Imaging, Bind 2023-April).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
White matter hypointensity growth rate correlates with rate of brain atrophy
Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon, Rostrup, E. & Nielsen, Mads, 2014, I: Alzheimer's & Dementia. 10, 4, Supplement, s. P414 1 s., P1-285.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › fagfællebedømt
- Udgivet
White matter hypointensity growth rate correlates with rate of brain atrophy
Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon, Rostrup, E. & Nielsen, Mads, 2014, I: Alzheimer's & Dementia. 10, 4, Supplement, s. P75-P76 2 s., IC-P-131.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › fagfællebedømt
- Udgivet
U-Time: A Fully Convolutional Network for Time Series Segmentation Applied to Sleep Staging
Perslev, M., Hejselbak Jensen, M., Darkner, Sune, Jørgen Jennum, P. & Igel, Christian, 1 okt. 2019, Advances in Neural Information Processing Systems 32 (NIPS 2019). NIPS Proceedings, Bind 32. s. 4415-4426Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
U-Sleep: resilient high-frequency sleep staging
Perslev, M., Darkner, Sune, Kempfner, L., Nikolic, M., Jennum, Poul & Igel, Christian, 15 apr. 2021, I: npj Digital Medicine. 4, 1, 12 s., 72.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
TopAwaRe: Topology-Aware Registration
Nielsen, R. K., Darkner, Sune & Feragen, A., 2019, Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2019 - 22nd International Conference, Proceedings. Shen, D., Yap, P-T., Liu, T., Peters, T. M., Khan, A., Staib, L. H., Essert, C. & Zhou, S. (red.). Springer VS, s. 364-372 9 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 11765 LNCS).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The minimal energetic requirement of sustained awareness after brain injury
Stender, J., Mortensen, K. N., Thibaut, A., Darkner, Sune, Laureys, S., Gjedde, Albert & Kupers, Ron, 6 jun. 2016, I: Current Biology. 26, 11, s. 1494-1499 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
The cartilage bone junction and its implications for deep canal hearing instrument fittings
Nielsen, C. & Darkner, Sune, 2011, I: Hearing Journal. 64, 3, s. 35-42 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
The added effect of artificial intelligence on physicians’ performance in detecting thoracic pathologies on CT and chest X-ray: A systematic review
Li, D., Pehrson, Lea Marie, Lauridsen, C. A., Tøttrup, L., Fraccaro, M., Elliott, Desmond, Zajac, Hubert Dariusz, Darkner, Sune, Carlsen, Jonathan Frederik & Nielsen, Michael Bachmann, 2021, I: Diagnostics. 11, 12, 17 s., 2206.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural parcellation of the thalamus using shortest-path tractography
Kasenburg, N., Darkner, Sune, Hahn, U., Liptrot, M. G. & Feragen, A., 2016, 2016 IEEE 13th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI). IEEE, s. 559-563 5 s. 7493330Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Streamlet Tractography
Liptrot, M. G., Darkner, Sune, Feragen, A. & Lauze, Francois Bernard, apr. 2017.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Stepwise inverse consistent Euler’s scheme for diffeomorphic image registration
Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sørensen, L., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2014, Biomedical Image Registration: 6th International Workshop, WBIR 2014, London, UK, July 7-8, 2014. Proceedings. Ourselin, S. & Modat, M. (red.). Springer, s. 223-230 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 8545).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Safety and Efficacy of Mesenchymal Stem Cells for Radiation-Induced Xerostomia: A Randomized, Placebo-Controlled Phase 1/2 Trial (MESRIX)
Grønhøj, C., Jensen, D. H., Vester-Glowinski, Peter Viktor, Jensen, S. B., Bardow, A., Oliveri, R. S., Fog, L. M., Specht, Lena, Thomsen, C., Darkner, Sune, Jensen, M., Müller, V., Kiss, K., Agander, T., Andersen, E., Fischer-Nielsen, A. & von Buchwald, Christian, 1 jul. 2018, I: International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics. 101, 3, s. 581-592 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
RootPainter3D: Interactive-machine-learning enables rapid and accurate contouring for radiotherapy
Smith, Abraham George, Petersen, Jens, Terrones-Campos, C., Berthelsen, A. K., Forbes, N. J., Darkner, Sune, Specht, Lena & Vogelius, I. R., 2022, I: Medical Physics. 49, 1, s. 461-473Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Revisiting Transformer-based Models for Long Document Classification
Dai, X., Chalkidis, Ilias, Darkner, Sune & Elliott, Desmond, 2022, Findings of the Association for Computational Linguistics: EMNLP 2022. Association for Computational Linguistics, s. 7212–7230Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Restoring drifted electron microscope volumes using synaptic vesicles at sub-pixel accuracy
Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2020, I: Communications Biology. 3, 1, 7 s., ´81.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Reducing Annotation Need in Self-explanatory Models for Lung Nodule Diagnosis
Lu, J., Yin, C., Krause, Oswin, Erleben, Kenny, Nielsen, Michael Bachmann & Darkner, Sune, 2022, Interpretability of Machine Intelligence in Medical Image Computing. Reyes, M., Abreu, PH. & Cardoso, J. (red.). Springer, s. 33-43 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 13611).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reconstructing Binary Signals from Local Histograms
Sporring, Jon & Darkner, Sune, 21 mar. 2022, I: Entropy. 24, 3, s. 1-11 433.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Pseudo-Label Guided Image Synthesis for Semi-Supervised COVID-19 Pneumonia Infection Segmentation
Lyu, F., Ye, M., Carlsen, J. F., Erleben, Kenny, Darkner, Sune & Yuen, P. C., 2023, I: IEEE Transactions on Medical Imaging. 42, 3, s. 797-809Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Performance and Agreement When Annotating Chest X-ray Text Reports - A Preliminary Step in the Development of a Deep Learning-Based Prioritization and Detection System
Li, D., Pehrson, Lea Marie, Bonnevie, R., Fraccaro, M., Thrane, J., Tøttrup, L., Lauridsen, C. A., Balaganeshan, Sedrah Butt, Jankovic, J., Andersen, T. T., Mayar, A., Hansen, Kristoffer Lindskov, Carlsen, Jonathan Frederik, Darkner, Sune & Nielsen, Michael Bachmann, 2023, I: Diagnostics. 13, 6, 24 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
OpenJaw Dataset
Gholamalizadeh, T., Darkner, Sune, Søndergaard, P. & Erleben, Kenny, 2021Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Datasæt › Forskning
- Udgivet
Open-Full-Jaw: An open-access dataset and pipeline for finite element models of human jaw
Gholamalizadeh, T., Moshfeghifar, Faezeh, Ferguson, Z., Schneider, T., Panozzo, D., Darkner, Sune, Makaremi, M., Chan, F., Lempel Søndergaard, P. & Erleben, Kenny, 1 sep. 2022, I: Computer Methods and Programs in Biomedicine. 224, 17 s., 107009.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Mandibular Teeth Movement Variations in Tipping Scenario: A Finite Element Study on Several Patients
Gholamalizadeh, T., Darkner, Sune, Cattaneo, P. M., Søndergaard, P. & Erleben, Kenny, 2020. 10 s.Publikation: Konferencebidrag › Paper › Forskning
- Udgivet
Locally orderless registration for diffusion weighted images
Jensen, H. G., Lauze, Francois Bernard, Nielsen, Mads & Darkner, Sune, 2015, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention -- MICCAI 2015: 18th international conference, Munich, Germany, October 5-9, 2015, Proceedings, Part II. Navab, N., Hornegger, J., Wells, W. M. & Frangi, A. F. (red.). Springer, s. 305-312 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 9350).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Locally orderless registration code: fast normalized mutual information and P-Norm for MATLAB
Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2012Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Softwareprogram › Forskning
- Udgivet
Locally orderless registration
Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2013, I: I E E E Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 35, 6, s. 1437-1450 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Locally Orderless Registration
Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2012, arxiv.org, 14 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
Localized cerebral atrophy acceleration during Alzheimer’s disease
Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Lillholm, Martin, Dam, E. B., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2013, I: Alzheimer's & Dementia. 9, 4, Supplement, s. P151 1 s., O1-10-06.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › fagfællebedømt
- Udgivet
Localized cerebral atrophy acceleration during Alzheimer’s disease
Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Lillholm, Martin, Dam, E. B., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2013, I: Alzheimer's & Dementia. 9, 4, Supplement, s. P36–P37 2 s., IC-P-059.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › fagfællebedømt
- Udgivet
LibHip: An open-access hip joint model repository suitable for finite element method simulation
Moshfeghifar, Faezeh, Gholamalizadeh, T., Ferguson, Z., Schneider, T., Nielsen, Michael Bachmann, Panozzo, D., Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2022, I: Computer Methods and Programs in Biomedicine. 226, 14 s., 107140.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Kernel bundle diffeomorphic image registration using stationary velocity fields and Wendland basis functions
Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2016, I: IEEE Transactions on Medical Imaging. 35, 6, s. 1369-1380 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Jet-based local image descriptors
Boesen Lindbo Larsen, A., Darkner, Sune, Dahl, A. L. & Steenstrup Pedersen, Kim, 2012, Computer Vision – ECCV 2012: 12th European Conference on Computer Vision, Florence, Italy, October 7-13, 2012, Proceedings, Part III. Fitzgibbon, A., Lazebnik, S., Perona, P., Sato, Y. & Schmid, C. (red.). Springer, s. 638-650 13 s. (Lecture notes in computer science, Bind 7574).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Jacobians for Lebesgue registration for a range of similarity measures
Sporring, Jon & Darkner, Sune, 2011, Department of Computer Science, University of Copenhagen. 8 s. (Koebenhavns Universitet. Datalogisk Institut. Rapport; Nr. 04/2011).Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport
- Udgivet
Inter- and Intra-Observer Agreement When Using a Diagnostic Labeling Scheme for Annotating Findings on Chest X-rays—An Early Step in the Development of a Deep Learning-Based Decision Support System
Li, D., Pehrson, Lea Marie, Tøttrup, L., Fraccaro, M., Bonnevie, R., Thrane, J., Sørensen, P. J., Rykkje, A., Andersen, T. T., Steglich-Arnholm, H., Stærk, D. M. R., Borgwardt, L., Hansen, Kristoffer Lindskov, Darkner, Sune, Carlsen, Jonathan Frederik & Nielsen, Michael Bachmann, 2022, I: Diagnostics. 12, 12, 3112.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Information-Theoretic Registration with Explicit Reorientation of Diffusion-Weighted Images
Jensen, H. G., Lauze, Francois Bernard & Darkner, Sune, 2022, I: Journal of Mathematical Imaging and Vision. 64, s. 1-16Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Image registration using stationary velocity fields parameterized by norm-minimizing Wendland kernel
Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, Medical Imaging 2015: Image Processing. SPIE - International Society for Optical Engineering, 7 s. (Proceedings of S P I E - International Society for Optical Engineering, Bind 9413).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hippocampal texture provides volume-independent information for Alzheimer's disease diagnosis
Sørensen, L., Pai, A. S. U., Darkner, Sune, Suhy, J., Oh, J., Chen, G., Igel, Christian & Nielsen, M., 2012, I: Alzheimer's & Dementia. 8, 4, Supplement, s. P162–P163 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift
- Udgivet
Hippocampal texture provides volume independent information for Alzheimer's diagnosis
Sørensen, L., Pai, A. S. U., Darkner, Sune, Suhy, J., Oh, J., Chen, G., Igel, Christian & Nielsen, Mads, 2012, I: Alzheimer's & Dementia. 8, 4, Supplement, s. 15 1 s., IC-P-013.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › fagfællebedømt
- Udgivet
Hippocampal texture predicts rate of cognitive decline in mild cognitive impairment
Pai, A. S. U., Pillai, J. A., Sørensen, L., Darkner, Sune, Sommer, Stefan Horst & Nielsen, Mads, jul. 2017, I: Alzheimer's & Dementia. 13, 7, supplement, s. P1356 1 s., P4-225.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift
- Udgivet
Hippocampal texture predicts one-year hippocampal atrophy in mild cognitively impaired subjects
Sørensen, L., Pai, A. S. U., Mysling, P., Darkner, Sune, Chen, G., Oh, J., Suhy, J., Igel, Christian & Nielsen, Mads, 2013. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Higher-order momentum distributions and locally affine LDDMM registration
Sommer, Stefan Horst, Nielsen, Mads, Darkner, Sune & Pennec, X., 2013, I: S I A M Journal on Imaging Sciences. 6, 1, s. 341-367 27 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Global Position Prediction for Interactive Motion Capture
Schreiner, Paul, Perepichka, M., Lewis, H., Darkner, Sune, Kry, P. G., Erleben, Kenny & Zordan, V. B., 2021, I: Proceedings of the ACM on Computer Graphics and Interactive Techniques. 4, 3, s. 1-16 3479985.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Generalized Partial Volume: an inferior density estimator to Parzen Windows for normalized mutual information
Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2011, Information Processing in Medical Imaging: 22nd International Conference, IPMI 2011, Kloster Irsee, Germany, July 3-8, 2011. Proceedings. Székely, G. & Hahn, H. K. (red.). Springer, s. 436-447 12 s. (Lecture notes in computer science, Bind 6801).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
First-in-man mesenchymal stem cells for radiation-induced xerostomia (MESRIX): study protocol for a randomized controlled trial.
Grønhøj, C., Jensen, D. H., Glovinski, P. V., mpw981, M., Jensen, A. B., Oliveri, R. S., Specht, Lena, Thomsen, C., Darkner, Sune, Kiss, K., Fischer-Nielsen, A. & von Buchwald, Christian, 2017, I: Trials. 18, 1, 10 s., 108.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
First Order Locally Orderless Registration
Darkner, Sune, Vidarte, J. D. T. & Lauze, Francois Bernard, 2021, Scale Space and Variational Methods in Computer Vision - 8th International Conference, SSVM 2021, Proceedings. Elmoataz, A., Fadili, J., Quéau, Y., Rabin, J. & Simon, L. (red.). Springer, s. 177-188 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 12679 LNCS).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Finding significantly connected voxels based on histograms of connection strengths
Kasenburg, N., Pedersen, M. V. & Darkner, Sune, 2016, Medical Imaging 2016: Image Processing. Styner, M. A. & Angelini, E. D. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 7 s. 978431. (Progress in Biomedical Optics and Imaging; Nr. 39, Bind 17).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fast Vortex Particle Method for Fluid-Character Interaction
Meldgaard, A., Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2022, I: OpenReview.net. 2022, 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel
- Udgivet
FDG-PET template MNI152 1mm
Darkner, Sune, 2013Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Datasæt › Forskning
ID: 18038443
Flest downloads
-
5770
downloads
Locally orderless registration
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
Udgivet -
4099
downloads
Jet-based local image descriptors
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
2998
downloads
FDG-PET template MNI152 1mm
Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Datasæt › Forskning
Udgivet