Anders Krogh

Anders Krogh

Professor


  1. Udgivet

    Novel viral genomes identified from six metagenomes reveal wide distribution of archaeal viruses and high viral diversity in terrestrial hot springs

    Islin, S. R., Menzel, P., Krogh, Anders, Young, M. & Peng, Xu, 2016, I: Environmental Microbiology. 18, 3, s. 863-874 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Signatures of RNA binding proteins globally coupled to effective microRNA target sites

    Jacobsen, A., Wen, J., Marks, D. S. & Krogh, Anders, 1 aug. 2010, I: Genome Research. 20, 8, s. 1010-9 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    miRMaid: a unified programming interface for microRNA data resources

    Jacobsen, A., Krogh, Anders, Kauppinen, S. & Lindow, M., 2010, I: BMC Bioinformatics. 11, Suppl 1, s. 29

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Assembly and analysis of 100 full MHC haplotypes from the Danish population

    Jensen, J. M., Villesen, P., Friborg, R. M., Mailund, T., Besenbacher, S., Sørensen, L. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Skov, L., Belling, K. G., Have, C. T., Izarzugaza, J. M. G., Grosjean, M., Bork-Jensen, J., Grove, J., Als, T. D., Huang, S., Chang, Y., Xu, R. & 39 flere, Ye, W., Rao, J., Guo, X., Sun, J., Cao, H., Ye, C., Beusekom, J. V., Espeseth, T., Flindt, E., Halager, A. E., Hellard, S. L., Hultman, C. M., Lescai, F., Li, S., Lund, O., Løngren, P., Matey-Hernandez, M. L., Mors, O., Pedersen, C. N. S., Sicheritz-Pontén, T., Sullivan, P., Syed, A., Westergaard, D., Yadav, R., Li, N., Xu, X., Hansen, Torben, Bolund, L., Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Gupta, R., Rasmussen, Simon, Børglum, A. D., Wang, J., Eiberg, Hans Rudolf Lytchoff, Kristiansen, Karsten, Brunak, Søren & Schierup, M. H., sep. 2017, I: Genome Research. 27, 9, s. 1597-1607 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Novel overlapping coding sequences in Chlamydia trachomatis

    Jensen, K. T., Petersen, L., Falk, S., Iversen, P., Andersen, P., Theisen, Michael & Krogh, Anders, 2006, I: FEMS Microbiology Reviews. 265, 1, s. 106-17

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Prediction of lipoprotein signal peptides in Gram-negative bacteria.

    Juncker, A. S., Willenbrock, H., Heijne, G. V., Nielsen, H. & Krogh, Anders, 2003, I: Protein Science. 12(8), s. 1652-1662

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Molecular composition of IMP1 ribonucleoprotein granules.

    Jønson, L., Vikesaa, J., Krogh, Anders, Nielsen, Lars Kamp, Hansen, T. V., Borup, R., Johnsen, A. H., Christiansen, Jan & Nielsen, Finn Cilius, 2007, I: Molecular and Cellular Proteomics. 6, 5, s. 798-811 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    A Combined Transmembrane Topology and Signal Peptide Prediction Method

    Kall, L., Krogh, Anders & Sonnhammer, E. L., 2004, I: Journal of Molecular Biology. Vol. 338 (5), s. 1027-36

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Adaptable probabilistic mapping of short reads using position specific scoring matrices

    Kerpedjiev, P., Frellsen, J., Lindgreen, S. & Krogh, Anders, 2014, I: B M C Bioinformatics. 15, 17 s., 15:100.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    What are artificial neural networks?

    Krogh, Anders, 2008, I: Nature Biotechnology. 26, 2, s. 195-7 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Advantages of combined transmembrane topology and signal peptide prediction--the Phobius web server.

    Käll, L., Krogh, Anders & Sonnhammer, E. L. L., 2007, I: Nucleic Acids Research. 35, Web Server issue, s. W429-32

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    An HMM posterior decoder for sequence feature prediction that includes homology information

    Käll, L., Krogh, Anders & Sonnhammer, E. L. L., 2005, I: Bioinformatics. 21, 1, s. i251 - i257

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    EasyGene - a prokaryotic gene finder that ranks ORFs by statistical significance

    Larsen, T. S. & Krogh, Anders, 2003, I: BMC Bioinformatics. 4(1), s. 21

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Context dependency of nucleotide probabilities and variants in human DNA

    Liang, Yuhu, Grønbæk, Christian, Fariselli, P. & Krogh, Anders, 2022, I: BMC Genomics. 23, 1, 15 s., 87.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    SNPest: a probabilistic graphical model for estimating genotypes

    Lindgreen, S., Krogh, Anders & Pedersen, Jakob Skou, 2014, I: BMC Research Notes. 7, 12 s., 298.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    MASTR: multiple alignment and structure prediction of non-coding RNAs using simulated annealing.

    Lindgreen, S., Gardner, P. P. & Krogh, Anders, 2007, I: Bioinformatics. 23, 24, s. 3304-11 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Measuring covariation in RNA alignments: Physical realism improves information measures

    Lindgreen, S., Gardner, P. P. & Krogh, Anders, 2006, I: Bioinformatics. 22, 24, s. 2988-2995 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Multiple alignment and structure prediction of non-coding RNA sequences

    Lindgreen, S., Gardner, P. P. & Krogh, Anders, 2007, I: BMC Bioinformatics. 8, Suppl. 8, 1 s., P8.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Intragenomic matching reveals a huge potential for miRNA-mediated regulation in plants.

    Lindow, M., Jacobsen, A., Nygaard, S., Mang, Y. & Krogh, Anders, 2007, I: PLoS Computational Biology. 3, 11, s. e238

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Computational evidence for hundreds of non-conserved plant microRNAs

    Lindow, M. & Krogh, Anders, 2005, I: BMC Genomics. 6, s. 119

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Genomic Analyses from Non-invasive Prenatal Testing Reveal Genetic Associations, Patterns of Viral Infections, and Chinese Population History

    Liu, S., Huang, S., Chen, F., Zhao, L., Yuan, Y., Francis, S. S., Fang, L., Li, Z., Lin, L., Liu, R., Zhang, Y., Xu, H., Li, S., Zhou, Y., Davies, R. W., Liu, Q., Walters, R. G., Lin, K., Ju, J., Komeliussen, T. & 18 flere, Yang, M. A., Fu, Q., Wang, J., Zhou, L., Krogh, Anders, Zhang, H., Wang, W., Chen, Z., Cai, Z., Yin, Y., Yang, H., Mao, M., Shendure, J., Wang, J., Albrechtsen, Anders, Jin, X., Nielsen, Rasmus & Xu, X., 2018, I: Cell. 175, 2, s. 347-359, e1-e7

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Discovery, genotyping and characterization of structural variation and novel sequence at single nucleotide resolution from de novo genome assemblies on a population scale

    Danish Pan Genome Consortium, D. P. G. C., Belling, K. G. & Rasmussen, Simon, 2015, I: GigaScience. 4, 13 s., 64.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Asap: a framework for over-representation statistics for transcription factor binding sites.

    Marstrand, T. T., Frellsen, J., Moltke, Ida, Thiim, M., Valen, E., Retelska, D. & Krogh, Anders, 2008, I: PLoS ONE. 3, 2, s. e1623

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. A sequence-profile-based HMM for predicting and discriminating β barrel membrane proteins

    Martelli, P. L., Fariselli, P., Krogh, Anders & Casadio, R., 2002, I: Bioinformatics. 18, Suppl. 1, s. S46-S53

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Reconstructing genome evolution in historic samples of the Irish potato famine pathogen

    Martin, M. D., Cappellini, Enrico, Samaniego Castruita, J. A., Zepeda Mendoza, M. L., Campos, P., Seguin-Orlando, A., Wales, N., Orlando, L. A. A., Ho, S. Y. W., Dietrich, F. S., Mieczkowski, P. A., Heitman, J., Willerslev, Eske, Krogh, Anders, Ristaino, J. B. & Gilbert, M Thomas P, 18 jul. 2013, I: Nature Communications. 4, 7 s., 2172.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 9738