Wouter Boomsma
Professor
Machine Learning
Universitetsparken 1
2100 København Ø
- Udgivet
Random coil chemical shifts for serine, threonine and tyrosine phosphorylation over a broad pH range
Hendus-Altenburger, R., Fernandes, Catarina, Bugge, K., Kunze, M. B. A., Boomsma, Wouter & Kragelund, Birthe Brandt, 2019, I: Journal of Biomolecular NMR. 73, 12, s. 713–725 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid expansion of the protein disulfide isomerase gene family facilitates the folding of venom peptides
Safavi, Helena, Li, Q., Jackson, R. L., Song, A. S., Boomsma, Wouter, Bandyopadhyay, P. K., Gruber, C. W., Purcell, A. W., Yandell, M., Olivera, B. M. & Ellgaard, Lars, 2016, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 113, 12, s. 3227-3232 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid protein stability prediction using deep learning representations
Blaabjerg, Lasse Møller, Kassem, M. M., Good, L. L., Jonsson, Nicolas, Cagiada, Matteo, Johansson, Kristoffer Enøe, Boomsma, Wouter, Stein, Amelie & Lindorff-Larsen, Kresten, 2023, I: eLife. 12, 19 s., e82593.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Robust estimation of diffusion-optimized ensembles for enhanced sampling
Tian, P., Jónsson, S. Æ., Ferkinghoff-Borg, J., Krivov, S. V. .., Lindorff-Larsen, Kresten, Irbäck, A. & Boomsma, Wouter, 2014, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 10, 2, s. 543–553 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Single-particle diffusional fingerprinting: A machine-learning framework for quantitative analysis of heterogeneous diffusion
Pinholt, H. D., Bohr, S. S. R., Iversen, J. F., Boomsma, Wouter & Hatzakis, Nikos, 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 31, 7 s., e2104624118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spherical convolutions and their application in molecular modelling
Boomsma, Wouter & Frellsen, J., 2017, Neural Information Processing Systems 2017. Guyon, I., Luxburg, U. V., Bengio, S., Wallach, H., Fergus, R., Vishwanathan, S. & Garnett, R. (red.). NIPS Proceedings, 11 s. (Advances in Neural Information Processing Systems, Bind 30).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Statistical assignment of DNA sequences using Bayesian phylogenetics
Terkelsen, K. M., Boomsma, Wouter, Huelsenbeck, J. P., Willerslev, Eske & Nielsen, Rasmus, 2008, I: Systematic Biology. 57, 5, s. 750-757 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structure of a functional amyloid protein subunit computed using sequence variation
Tian, P., Boomsma, Wouter, Wang, Y., Otzen, D., Jensen, Mogens Høgh & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: Journal of the American Chemical Society. 137, 1, s. 22–25 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structure of the bacterial cytoskeleton protein bactofilin by NMR chemical shifts and sequence variation
Kassem, M. M., Wang, Y., Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2016, I: Biophysical Journal. 110, 11, s. 2342-2348 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Subtle Monte Carlo updates in dense molecular systems
Bottaro, S., Boomsma, Wouter, Johansson, Kristoffer Enøe, Andreetta, C., Hamelryck, Thomas Wim & Ferkinghoff-Borg, J., 2012, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 8, 2, s. 695-702 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The PCNA interaction motifs revisited: thinking outside the PIP-box
Prestel, Andreas, Wichmann, N., Martins, J. M., Marabini, R., Kassem, N., Broendum, S. S., Otterlei, M., Nielsen, Olaf, Willemoës, Martin, Ploug, Michael, Boomsma, Wouter & Kragelund, Birthe Brandt, 2019, I: Cellular and Molecular Life Sciences. 76, 24, s. 4923-4943Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Using adaptive operator scheduling on problem domains with an operator manifold: applications to the travelling salesman problem
Boomsma, Wouter, 2003, The 2003 Congress on Evolutionary Computation, 2003. CEC'03. IEEE, s. 1274-1279 6 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
What does evolution tell us about the structure of a functional amyloid protein?
Tian, P., Boomsma, Wouter, Wang, Y., Otzen, D. E., Jensen, Mogens Høgh & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: Biophysical Journal. 108, 2, Supplement 1, s. 227a 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt
ID: 40103911
Flest downloads
-
2308
downloads
Protein structure validation and refinement using amide proton chemical shifts derived from quantum mechanics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1431
downloads
Potentials of mean force for protein structure prediction vindicated, formalized and generalized
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1431
downloads
Inference of structure ensembles of flexible biomolecules from sparse, averaged data
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet