Anders Krogh

Anders Krogh

Professor


  1. 2008
  2. Udgivet

    Modeling promoter grammars with evolving hidden Markov models

    Won, K., Sandelin, Albin Gustav, Marstrand, T. T. & Krogh, Anders, 2008, I: Bioinformatics. 24, 15, s. 1669-75 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    What are artificial neural networks?

    Krogh, Anders, 2008, I: Nature Biotechnology. 26, 2, s. 195-7 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. 2007
  5. Udgivet

    A code for transcription initiation in mammalian genomes

    Frith, M. C., Valen, E. D., Krogh, Anders, Hayashizaki, Y., Carninci, P. & Sandelin, Albin Gustav, 2007, I: Genome Research. 18, 1, s. 1-12 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Advantages of combined transmembrane topology and signal peptide prediction--the Phobius web server.

    Käll, L., Krogh, Anders & Sonnhammer, E. L. L., 2007, I: Nucleic Acids Research. 35, Web Server issue, s. W429-32

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    An evolutionary method for learning HMM structure: prediction of protein secondary structure.

    Won, K., Hamelryck, Thomas Wim, Prügel-Bennett, A. & Krogh, Anders, 2007, I: BMC Bioinformatics. 8, s. 357

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Intragenomic matching reveals a huge potential for miRNA-mediated regulation in plants.

    Lindow, M., Jacobsen, A., Nygaard, S., Mang, Y. & Krogh, Anders, 2007, I: PLoS Computational Biology. 3, 11, s. e238

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    MASTR: multiple alignment and structure prediction of non-coding RNAs using simulated annealing.

    Lindgreen, S., Gardner, P. P. & Krogh, Anders, 2007, I: Bioinformatics. 23, 24, s. 3304-11 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Molecular composition of IMP1 ribonucleoprotein granules.

    Jønson, L., Vikesaa, J., Krogh, Anders, Nielsen, Lars Kamp, Hansen, T. V., Borup, R., Johnsen, A. H., Christiansen, Jan & Nielsen, Finn Cilius, 2007, I: Molecular and Cellular Proteomics. 6, 5, s. 798-811 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Multiple alignment and structure prediction of non-coding RNA sequences

    Lindgreen, S., Gardner, P. P. & Krogh, Anders, 2007, I: BMC Bioinformatics. 8, Suppl. 8, 1 s., P8.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Prediction of Structurally-Determined Coiled-Coil Domains with Hidden Markov Models

    Fariselli, P., Molinini, D., Casadio, R. & Krogh, Anders, 2007, Bioinformatics Research and Development: First International Conference, BIRD 2007 Proceedings. Hochreiter, S. & Wagner, R. (red.). Springer, s. 292-302 11 s. (Lecture Notes in Bioinformatics, Bind 4414).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  13. 2006
  14. Udgivet

    A hidden Markov model approach for determining expression from genomic tiling micro arrays

    Terkelsen, K. M., Gardner, P. P., Arctander, P. & Krogh, Anders, 2006, I: BMC Bioinformatics. 7, 239

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Automatic generation of gene finders for eukaryotic species

    Terkelsen, K. M. & Krogh, Anders, 2006, I: BMC Bioinformatics. 7, 263

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Evolving the structure of hidden Markov Models

    won, K. J., Prugel-Bennett, A. & Krogh, Anders, 2006, I: IEEE Transactions on Evolutionary Computation. 10, 1, s. 39-49

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Measuring covariation in RNA alignments: Physical realism improves information measures

    Lindgreen, S., Gardner, P. P. & Krogh, Anders, 2006, I: Bioinformatics. 22, 24, s. 2988-2995 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Novel overlapping coding sequences in Chlamydia trachomatis

    Jensen, K. T., Petersen, L., Falk, S., Iversen, P., Andersen, P., Theisen, Michael & Krogh, Anders, 2006, I: FEMS Microbiology Reviews. 265, 1, s. 106-17

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    PONGO: a web server for multiple predictions of all-alpha transmembrane proteins

    Amico, M., Finelli, M., Rossi, I., Zauli, A., Elofsson, A., Viklund, H., Heijne, G. V., Joes, D., Krogh, Anders, Fariselli, P., Luigi, M. P. & Casadio, R., 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, s. W169-72

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Sampling Realistic Protein Conformations Using Local Structural Bias

    Hamelryck, Thomas Wim, Kent, J. T. & Krogh, Anders, 2006, I: PLoS ONE. 2, 9, s. e131

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. 2005
  22. Udgivet

    An HMM posterior decoder for sequence feature prediction that includes homology information

    Käll, L., Krogh, Anders & Sonnhammer, E. L. L., 2005, I: Bioinformatics. 21, 1, s. i251 - i257

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Computational evidence for hundreds of non-conserved plant microRNAs

    Lindow, M. & Krogh, Anders, 2005, I: BMC Genomics. 6, s. 119

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Evolving hidden Markov models for protein secondary structure prediction

    Won, K. J., Hamelryck, Thomas Wim, Prügel-Bennett, A. & Krogh, Anders, 2005, The 2005 IEEE Congress on Evolutionary Computation, IEEE CEC 2005: Proceedings. IEEE, Bind 3. s. 33-40 8 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Large-scale prokaryotic gene prediction and comparison to genome annotation

    Nielsen, P. & Krogh, Anders, 2005, I: Bioinformatics. 21, 24, s. 4322-9

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. 2004
  27. Udgivet

    A Combined Transmembrane Topology and Signal Peptide Prediction Method

    Kall, L., Krogh, Anders & Sonnhammer, E. L., 2004, I: Journal of Molecular Biology. Vol. 338 (5), s. 1027-36

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Teaching computers to fold proteins

    Winther, O. & Krogh, Anders, 2004, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). Vol. 70 (3) pt. 1, s. 030903

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  29. Udgivet

    The Block Hidden Markov Model for Biological Sequence Analysis

    Won, K. J., Prügel-Bennett, A. & Krogh, Anders, 2004, Knowledge-BasedIntelligent Informationand Engineering Systems: 8th International Conference, KES 2004, Proceedings. Negoita, M. G., Howlett, R. J. & Jain, L. (red.). Springer, Bind 1. s. 64-70 7 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 3213).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Training HMM structure with genetic algorithm for biological sequence analysis

    Won, K. J. & Krogh, Anders, 2004, I: Bioinformatics. Vol. 20 (18), s. 3613-9

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 9738