Anders Krogh
Professor
Machine Learning
Universitetsparken 1, 2100 København Ø
Center for Health Data Science
Blegdamsvej 3B
2200 København N
- 2011
- Udgivet
miR-449 inhibits cell proliferation and is down-regulated in gastric cancer
Bou Kheir, T., Futoma-Kazmierczak, E., Jacobsen, A., Krogh, Anders, Bardram, L., Hother, C., Grønbæk, Kirsten, Federspiel, B., Lund, Anders H. & Friis-Hansen, Lennart Jan, 2011, I: Molecular Cancer. 10, s. 1-12 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
microRNA-101 is a potent inhibitor of autophagy
Frankel, Lisa, Wen, J., Lees, M., Høyer-Hansen, M., Farkas, T., Krogh, Anders, Jäättelä, M. & Lund, Anders H., 2011, I: E M B O Journal. 30, s. 4628-4641 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
- Udgivet
Improving ancient DNA read mapping against modern reference genomes
Schubert, Mikkel, Ginolhac, A., Lindgreen, S., Thompson, J. F., Al-Rasheid, K. A. S., Willerslev, Eske, Krogh, Anders & Orlando, L. A. A., 2012, I: BMC Genomics. 13, 15 s., 178.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mammalian tissues defective in nonsense-mediated mRNA decay display highly aberrant splicing patterns
Weischenfeldt, Joachim Lütken, Waage, J. E., Tian, G., Zhao, J., Damgaard, I., Jakobsen, J. S., Kristiansen, Karsten, Krogh, Anders, Wang, J. & Porse, Bo Torben, 2012, I: Genome Biology (Online Edition). 13, 5, 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
microRNA-143 down-regulates Hexokinase 2 in colon cancer cells
Gregersen, Lea Haarup, Jacobsen, A., Frankel, Lisa, Wen, J., Krogh, Anders & Lund, Anders H., 2012, I: B M C Cancer. 12, 232, 23 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
microRNA-146a inhibits G protein-coupled receptor-mediated activation of NF-κB by targeting CARD10 and COPS8 in gastric cancer
Crone, S. G., Jacobsen, A., Federspiel, B., Bardram, L., Krogh, Anders, Lund, Anders H. & Friis-Hansen, Lennart Jan, 2012, I: Molecular Cancer. 11, 71, s. 71 31 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2013
- Udgivet
A short-read multiplex sequencing method for reliable, cost-effective and high-throughput genotyping in large-scale studies: [plus] Erratum
Cao, H., Wang, Y., Zhang, W., Chai, X., Zhang, X., Chen, S., Yang, F., Zhang, C., Guo, Y., Liu, Y., Tang, Z., Chen, C., Xue, Y., Zhen, H., Xu, Y., Rao, B., Liu, T., Zhao, M., Zhang, W., Li, Y. & 6 flere, , 2013, I: Human Mutation. 34, 12, s. 1715-1720 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Alterations in polyadenylation and its implications for endocrine disease
Rehfeld, Anders Aagaard, Plass, M., Krogh, Anders & Friis-Hansen, Lennart Jan, 2013, I: Frontiers in Endocrinology. 4, 23 s., 53.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome analysis reveals insights into physiology and longevity of the Brandt's bat Myotis brandtii
Seim, I., Fang, X., Xiong, Z., Lobanov, A. V., Huang, Z., Ma, S., Feng, Y., Turanov, A. A., Zhu, Y., Lenz, T. L., Gerashchenko, M. V., Fan, D., Yim, S. H., Yao, X., Jordan, D., Xiong, Y., Ma, Y., Lyapunov, A. N., Chen, G., Kulakova, O. I. & 9 flere, , 2013, I: Nature Communications. 4, 8 s., 2212.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Improving The Analysis Of Gene Expression Profiles By Comparing AML Blasts With Their Nearest Normal Counterparts
Rapin, N., Bagger, F. O., Jendholm, J., Mora-Jensen, H. I., Krogh, Anders, Kohlmann, A., Thiede, C., Borregaard, N., Bullinger, L., Winther, Ole, Theilgaard-Mønch, Kim & Porse, Bo Torben, 2013, I: Blood. 122, 21Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Loss of miR-10a activates Lpo and collaborates with activated Wnt signaling in inducing intestinal Neoplasia in female mice
Stadthagen Gomez, G., Tehler, D. E., Høyland-Kroghsbo, Nina Molin, Wen, J., Krogh, Anders, Jensen, K. T., Santoni Rugiu, Eric, Engelholm, Lars Henning & Lund, Anders H., 2013, I: P L o S Genetics. 9, 10, 12 s., e1003913.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
On the accuracy of short read mapping
Menzel, K. P., Frellsen, J., Plass, M., Rasmussen, S. H. & Krogh, Anders, 2013, Deep Sequencing Data Analysis. Shomron, N. (red.). Springer Science+Business Media, s. 39-59 21 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1038).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
cWords - systematic microRNA regulatory motif discovery from mRNA expression data
Rasmussen, S. H., Jacobsen, A. & Krogh, Anders, 2013, I: Silence. 4, 2, 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Recalibrating Equus evolution using the genome sequence of an early Middle Pleistocene horse
Orlando, L. A. A., Ginolhac, A., Zhang, G., Froese, D., Albrechtsen, A., Stiller, M., Schubert, M., Cappellini, E., Petersen, B., Moltke, I., Johnson, P. L. F., Fumagalli, M., Mouatt, J. T. V., Raghavan, M., Korneliussen, T. S., Malaspinas, A. S., Vogt, J., Szklarczyk, D. M., Kelstrup, C., Vinther, J. & 36 flere, , 4 jul. 2013, I: Nature. 499, 7456, s. 74-78 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reconstructing genome evolution in historic samples of the Irish potato famine pathogen
Martin, M. D., Cappellini, Enrico, Samaniego Castruita, J. A., Zepeda Mendoza, M. L., Campos, P., Seguin-Orlando, A., Wales, N., Orlando, L. A. A., Ho, S. Y. W., Dietrich, F. S., Mieczkowski, P. A., Heitman, J., Willerslev, Eske, Krogh, Anders, Ristaino, J. B. & Gilbert, M Thomas P, 18 jul. 2013, I: Nature Communications. 4, 7 s., 2172.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2014
- Udgivet
Adaptable probabilistic mapping of short reads using position specific scoring matrices
Kerpedjiev, P., Frellsen, J., Lindgreen, S. & Krogh, Anders, 2014, I: B M C Bioinformatics. 15, 17 s., 15:100.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Adaptations to a subterranean environment and longevity revealed by the analysis of mole rat genomes
Fang, X., Seim, I., Huang, Z., Gerashchenko, M. V., Xiong, Z., Turanov, A. A., Zhu, Y., Lobanov, A. V., Fan, D., Yim, S. H., Yao, X., Ma, S., Yang, L., Lee, S-G., Kim, E. B., Bronson, R. T., Sumbera, R., Buffenstein, R., Zhou, X., Krogh, A. & 4 flere, , 2014, I: Cell Reports. 8, 5, s. 1354-1364 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Algorithms for mapping high-throughput DNA sequences
Frellsen, J., Menzel, P. & Krogh, Anders, 2014, Comprehensive Biomedical Physics: Bioinformatics. Brahme, A. (red.). Elsevier, Bind 6. s. 41-50 10 s. (Reference Module in Biomedical Sciences, Bind 6).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Alternative polyadenylation of tumor suppressor genes in small intestinal neuroendocrine tumors
Rehfeld, Anders Aagaard, Plass, M., Døssing, K., Knigge, Ulrich, Kjær, Andreas, Krogh, Anders & Friis-Hansen, Lennart Jan, 2014, I: Frontiers in Endocrinology. 5, 10 s., 46.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bayesian transcriptome assembly
Sørensen, L. M., Sibbesen, Jonas Andreas & Krogh, Anders, 2014, I: Genome Biology (Online Edition). 15, 10, 11 s., 501.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome-wide adaptive complexes to underground stresses in blind mole rats Spalax
Fang, X., Nevo, E., Han, L., Levanon, E. Y., Zhao, J., Avivi, A., Larkin, D., Jiang, X., Feranchuk, S., Zhu, Y., Fishman, A., Feng, Y., Sher, N., Xiong, Z., Hankeln, T., Huang, Z., Gorbunova, V., Zhang, L., Zhao, W., Wildman, D. E. & 33 flere, , 2014, I: Nature Communications. 5, 9 s., 3966.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome-wide nucleosome map and cytosine methylation levels of an ancient human genome
Pedersen, J. S., Valen, E., Velazquez, A. M. V., Parker, B. J., Rasmussen, M., Lindgreen, S., Lilje, B., Tobin, D. J., Kelly, T. K., Vang, S., Andersson, R., Jones, P. A., Hoover, C. A., Tikhonov, A., Prokhortchouk, E., Rubin, E. M., Sandelin, A. G., Gilbert, M. T. P., Krogh, A., Willerslev, E. & 1 flere, , 2014, I: Genome Research. 24, 3, s. 454-466 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid detection of structural variation in a human genome using nanochannel-based genome mapping technology
Cao, H., Hastie, A. R., Cao, D., Lam, E. T., Sun, Y., Huang, H., Liu, X., Lin, L., Andrews, W., Chan, S., Huang, S., Tong, X., Requa, M., Anantharaman, T., Krogh, Anders, Yang, H., Cao, H. & Xu, X., 2014, I: GigaScience. 3, 11 s., 34.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
SNPest: a probabilistic graphical model for estimating genotypes
Lindgreen, S., Krogh, Anders & Pedersen, Jakob Skou, 2014, I: BMC Research Notes. 7, 12 s., 298.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Whole-genome sequencing of cultivated and wild peppers provides insights into Capsicum domestication and specialization
Qin, C., Yu, C., Shen, Y., Fang, X., Chen, L., Min, J., Cheng, J., Zhao, S., Xu, M., Luo, Y., Yang, Y., Wu, Z., Mao, L., Wu, H., Ling-Hu, C., Zhou, H., Lin, H., Gonzalez-Morales, S., Trejo-Saavedra, D. L., Tian, H. & 53 flere, , 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 14, s. 5135-5140 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 9738
Flest downloads
-
6189
downloads
Reconstructing genome evolution in historic samples of the Irish potato famine pathogen
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3413
downloads
microRNA-146a inhibits G protein-coupled receptor-mediated activation of NF-κB by targeting CARD10 and COPS8 in gastric cancer
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3325
downloads
Improving ancient DNA read mapping against modern reference genomes
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet