Jens Petersen
Lektor
Image Analysis, Computational Modelling and Geometry
Universitetsparken 1
2100 København Ø
- Udgivet
Visual assessment of early emphysema and interstitial abnormalities on CT is useful in lung cancer risk analysis
Wille, M. M. W., Thomsen, L. H., Petersen, Jens, de Bruijne, Marleen, Dirksen, A., Pedersen, J. H. & Shaker, S. B., 2016, I: European Radiology. 26, 2, s. 487-494 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Tree-space statistics and approximations for large-scale analysis of anatomical trees
Feragen, A., Owen, M., Petersen, Jens, Wille, M. M. W., Thomsen, L. H., Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2013, Information Processing in Medical Imaging: 23rd International Conference, IPMI 2013, Asilomar, CA, USA, June 28–July 3, 2013. Proceedings. Gee, J. C., Joshi, S., Pohl, K. M., Wells, W. M. & Zöllei, L. (red.). Springer, s. 74-85 12 s. (Lecture notes in computer science, Bind 7917).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The effect of inspiration on airway dimensions measured in CT images from the Danish Lung Cancer Screening Trial
Petersen, Jens, Wille, M., Thomsen, L., Feragen, A., Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2013, I: Insights into Imaging. 4, Supplement 1, s. 183 1 s., B-0163.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural characterisation of multilayer lipid bilayer by small-angel neutron and X-ray scattering
Ishoy, T., Lemmich, J., Ipsen, J., Honger, T., Petersen, Jens, Kharkar, J., Nylander, T., Mortensen, Kell, Bauer, R. & Mouritsen, Ole G., 1 jan. 2001, I: Biophysical Society. Annual Meeting. Abstracts. 80, 1, s. 522A-522APublikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Semi-automated detection of pulmonary congestion in patients with non-ST acute coronary syndrome by using of quantitative chest cardiac-CT analysis: Analysis of methodological aspects
Fabricius-Bjerre, A. A., Petersen, Jens, Heitmann, Merete, Elming, H., Ashraf, H., Kofoed, Klaus Fuglsang, Kuhl, J. T., Køber, Lars Valeur & Nielsen, Olav Wendelboe, 2018, I: European Journal of Heart Failure. 20, S1, s. 475-476 P1854.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Segmenting Two-Dimensional Structures with Strided Tensor Networks
Selvan, Raghav, Dam, Erik Bjørnager & Petersen, Jens, 2021, Information Processing in Medical Imaging - 27th International Conference, IPMI 2021, Proceedings. Feragen, A., Sommer, S., Schnabel, J. & Nielsen, M. (red.). Springer, s. 401-414 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 12729 LNCS).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Segmentation of roots in soil with U-Net
Smith, Abraham George, Petersen, Jens, Selvan, Raghav & Rasmussen, Camilla Ruø, 2020, I: Plant Methods. 16, s. 1-15 13.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Scalable kernels for graphs with continuous attributes
Feragen, A., Kasenburg, N., Petersen, Jens, de Bruijne, Marleen & Borgwardt, K., 2013, 27th Annual Conference on Neural Information Processing Systems 2013: NIPS 2013. Burges, C. J. C., Bottou, L., Welling, M., Ghahramani, Z. & Weinberger, K. Q. (red.). Curran Associates, Inc., s. 216-224 9 s. (Advances in Neural Information Processing Systems, Bind 26).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RootPainter3D: Interactive-machine-learning enables rapid and accurate contouring for radiotherapy
Smith, Abraham George, Petersen, Jens, Terrones-Campos, C., Berthelsen, A. K., Forbes, N. J., Darkner, Sune, Specht, Lena & Vogelius, I. R., 2022, I: Medical Physics. 49, 1, s. 461-473Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RootPainter: deep learning segmentation of biological images with corrective annotation
Smith, Abraham George, Han, Eusun, Petersen, Jens, Olsen, N. A. F., Giese, C., Athmann, M., Dresbøll, Dorte Bodin & Thorup-Kristensen, Kristian, 2022, I: New Phytologist. 236, s. 774-791 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reproducibility of a combined artificial intelligence and optimal-surface graph-cut method to automate bronchial parameter extraction
Dudurych, I., Garcia-Uceda, A., Petersen, Jens, Du, Y., Vliegenthart, R. & de Bruijne, Marleen, 2023, I: European Radiology. 33, s. 6718–6725Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantitative analysis of airway abnormalities in CT
Petersen, Jens, Lo, P. C. P., Nielsen, Mads, Edula, G., Ashraf, H., Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2010, Medical Imaging 2010: computer-aided Diagnosis. Karssemeijer, N. & Summers, R. M. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 12 s. 76241S. (Progress in Biomedical Optics and Imaging; Nr. 34, Bind 11).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantitative airway analysis in longitudinal studies using groupwise registration and 4D optimal surfaces
Petersen, Jens, Modat, M., Cardoso, M. J., Dirksen, A., Ourselin, S. & de Bruijne, Marleen, 2013, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2013: 16th International Conference, Nagoya, Japan, September 22-26, 2013, Proceedings, Part II. Mori, K., Sakuma, I., Sato, Y., Barillot, C. & Navab, N. (red.). Springer, Bind 2. s. 287-294 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 8150).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantifying emphysema extent from weakly labeled CT scans of the lungs using label proportions learning
Ørting, S. N., Petersen, Jens, Wille, M., Thomsen, L. & de Bruijne, Marleen, 2016, The Sixth International Workshop on Pulmonary Image Analysis. Beichel, R. R., Farahani, K., Jacobs, C., Kabus, S., Kiraly, A. P., Kuhnigk, J-M., McClelland, J. R., Mori, K., Petersen, J. & S. R. (red.). CreateSpace Independent Publishing Platform , s. 31-42 11 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantification and visualization of variation in anatomical trees
Amenta, N., Datar, M., Dirksen, A., de Bruijne, Marleen, Feragen, A., Ge, X., Pedersen, J., Howard, M., Owen, M., Petersen, Jens, Shi, J. & Xu, Q., 2015, Research in shape modeling. Leonard, K. & Tari, S. (red.). Springer, s. 57-79 23 s. (Association for Women in Mathematics Series, Bind 1).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Prediction of Radiation-induced Lymphopenia following Exposure of the Thoracic Region and Associated Risk of Infections and Mortality
Terrones-Campos, C., Ledergerber, B., Forbes, N., Smith, Abraham George, Petersen, Jens, Helleberg, Marie, Lundgren, Jens, Specht, Lena & Vogelius, Ivan R. , 2023, I: Clinical Oncology. 35, 7, s. e434-e444 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population-based Incidence of Myopericarditis After COVID-19 Vaccination in Danish Adolescents
Nygaard, Ulrikka, Holm, M., Bohnstedt, Cathrine, Chai, Q., Schmidt, Lisbeth Samsø, Hartling, U. B., Petersen, Jens, Thaarup, J., Bjerre, J., Vejlstrup, N. G., Juul, K. & Stensballe, Lone Graff, jan. 2022, I: Pediatric Infectious Disease Journal. 41, 1, s. E25-E28 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Patch-based Medical Image Segmentation using Matrix Product State Tensor Networks
Selvan, Raghav, Dam, Erik Bjørnager, Flensborg, S. A. & Petersen, Jens, 2022, I: The Journal of Machine Learning for Biomedical Imaging. 2022, s. 1-24 005.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Optimal surface segmentation using flow lines to quantify airway abnormalities in chronic obstructive pulmonary disease
Petersen, Jens, Nielsen, Mads, Lo, P. C. P., Nordenmark, L. H., Pedersen, J. J. H., Wille, M. M. W., Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2014, I: Medical Image Analysis. 18, 3, s. 531-541 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Optimal graph based segmentation using flow lines with application to airway wall segmentation
Petersen, Jens, Nielsen, Mads, Lo, P. C. P., Saghir, Z., Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2011, Information Processing in Medical Imaging: 22nd International Conference, IPMI 2011, Kloster Irsee, Germany, July 3-8, 2011. Proceedings. Székely, G. & Hahn, H. K. (red.). Springer, s. 49-60 12 s. (Lecture notes in computer science, Bind 6801).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Opfront: mesh
Petersen, Jens, 16 aug. 2015Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Softwareprogram › Forskning
- Udgivet
Opfront: optimal front segmentation of images
Petersen, Jens, 2014Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Softwareprogram › Forskning
- Udgivet
Multisystem inflammatory syndrome in children occurred in one of four thousand children with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
Holm, M., Hartling, U. B., Schmidt, Lisbeth Samsø, Glenthøj, J. P., Kruse, A., Rytter, Maren Johanne Heilskov, Lindhard, M. S., Lawaetz, M. C., Zaharov, T., Petersen, Jens, Andersen, R. M., Lemvik, G., Marcinski, P., Thaarup, J., Jensen, Lise Heilmann, Borch, L., Nielsen, A. B., Vissing, N. H., Schmiegelow, Kjeld & Nygaard, Ulrikka, sep. 2021, I: Acta Paediatrica, International Journal of Paediatrics. 110, 9, s. 2581-2583 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Mean Field Network Based Graph Refinement with Application to Airway Tree Extraction
Selvan, Raghav, Welling, M., Pedersen, J. J. H., Petersen, Jens & de Bruijne, Marleen, 2018, Medical Image Computingand Computer AssistedIntervention – MICCAI 2018: 21st International Conference, Granada, Spain, September 16–20, 2018, Proceedings, Part II. Frangi, A. F., Schnabel, J. A., Davatzikos, C., Alberola-López, C. & Fichtinger, G. (red.). Springer, s. 750-758 (Lecture notes in computer science, Bind 11071).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
ID: 22733621
Flest downloads
-
2074
downloads
Geometric tree kernels: classification of COPD from airway tree geometry
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1968
downloads
A hierarchical scheme for geodesic anatomical labeling of airway trees
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1502
downloads
Quantitative airway analysis in longitudinal studies using groupwise registration and 4D optimal surfaces
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet