Jens Petersen
Lektor
Image Analysis, Computational Modelling and Geometry
Universitetsparken 1
2100 København Ø
- Udgivet
Maximization of regional probabilities using Optimal Surface Graphs: application to carotid artery segmentation in MRI
Arias Lorza, A. M., Van Engelen, A., Petersen, Jens, Van Der Lugt, A. & de Bruijne, Marleen, 1 mar. 2018, I: Medical Physics. 45, 3, s. 1159-1169Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Manual airway labeling has limited reproducibility
Petersen, Jens, Feragen, A., Thomsen, L. H., Wille, M. M. W., Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2013. 10 s.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Longitudinal analysis of airways using registration
Petersen, Jens, Gorbunova, V., Nielsen, Mads, Dirksen, A., Lo, P. C. P. & de Bruijne, Marleen, 2011, The Fourth International Workshop on Pulmonary Image Analysis. Beichel, R., de Bruijne, M., van Ginneken, B., Kabus, S., Kiraly, A., Kuhnigk, J-M., McClelland, J., Mori, K., van Rikxoort, E. & Rit, S. (red.). CreateSpace Independent Publishing Platform , s. 11-22 12 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Learning to quantify emphysema extent: What labels do we need?
Orting, S. N., Petersen, Jens, Thomsen, L. H., Winkler Wille, M. M. & de Bruijne, Marleen, 2020, I: IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics. 24, 4, s. 1149 -1159Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interpreting Latent Spaces of Generative Models for Medical Images using Unsupervised Methods
Schön, Julian Elisha, Selvan, Raghav & Petersen, Jens, 2022, Deep Generative Models: Second MICCAI Workshop, DGM4MICCAI 2022, Held in Conjunction with MICCAI 2022, Singapore, September 22, 2022, Proceedings. Springer, s. 24-33 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 13609).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interobserver variability in visual evaluation of thoracic CT scans and comparison with automatic computer measurements of CT lung density
Wille, M. M. W., Thomsen, L. H., Petersen, Jens, Shaker, S. B., Dirksen, A. & Pedersen , J. H., 2012, I: European Respiratory Journal. 40, Supplement 56, s. 25s 1 s., P270.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interfractional dose accumulation for MR-guided liver SBRT: Variation among algorithms is highly patient- and fraction-dependent
Wahlstedt, I., Smith, Abraham George, Andersen, C. E., Behrens, C. P., Nørring Bekke, S., Boye, K., van Overeem Felter, M., Josipovic, Mirjana, Petersen, Jens, Risumlund, S. L., Tascón-Vidarte, J. D., van Timmeren, J. E. & Vogelius, Ivan R. , 2023, I: Radiotherapy and Oncology. 182, 9 s., 109448.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Increasing Accuracy of Optimal Surfaces Using Min-marginal Energies
Petersen, Jens, Arias-Lorza, A. M., Selvan, Raghav, Bos, D., van der Lugt, A., Pedersen, J. H., Nielsen, Mads & de Bruijne, Marleen, 1 jan. 2019, I: IEEE Transactions on Medical Imaging. 38, 7, s. 1559-1568 8599009.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Harnessing data science to advance radiation oncology
Vogelius, Ivan R. , Petersen, Jens & Bentzen, S. M., 2020, I: Molecular Oncology. 14, 7, s. 1514–1528Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Graph cut-based segmentation
Petersen, Jens, Oguz, I. & de Bruijne, Marleen, 2023, Medical Image Analysis. Academic Press, s. 247-273Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Graph Refinement based Airway Extraction using Mean-Field Networks and Graph Neural Networks
Selvan, Raghav, Kipf, T., Welling, M., Juarez, A. G., Pedersen, J. H., Petersen, Jens & de Bruijne, Marleen, 2020, I: Medical Image Analysis. 64, 12 s., 101751.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Geometric tree kernels: classification of COPD from airway tree geometry
Feragen, A., Petersen, Jens, Grimm, D., Dirksen, A., Pedersen, J. J. H., Borgwardt, K. & de Bruijne, Marleen, 2013, Information Processing in Medical Imaging: 23rd International Conference, IPMI 2013, Asilomar, CA, USA, June 28–July 3, 2013. Proceedings. Gee, J. C., Joshi, S., Pohl, K. M., Wells, W. M. & Zöllei, L. (red.). Springer, s. 171-183 13 s. (Lecture notes in computer science, Bind 7917).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Geodesic atlas-based labeling of anatomical trees: application and evaluation on airways extracted from CT
Feragen, A., Petersen, Jens, Owen, M., Lo, P., Thomsen, L. H., Wille, M. M. W., Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2015, I: IEEE Transactions on Medical Imaging. 34, 6, s. 1212-1226 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Feature Learning Based on Visual Similarity Triplets in Medical Image Analysis: A Case Study of Emphysema in Chest CT Scans
Nyboe Ørting, S., Petersen, Jens, Cheplygina, V., Thomsen, L. H., Wille, M. M. W. & de Bruijne, Marleen, 2018, Intravascular Imaging and Computer Assisted Stenting and Large-Scale Annotation of Biomedical Data and Expert Label Synthesis: 7th Joint International Workshop, CVII-STENT 2018 and Third International Workshop, LABELS 2018 Held in Conjunction with MICCAI 2018 Granada, Spain, September 16, 2018 Proceedings. Stoyanov, D., Taylor, Z., Balocco, S. & Sznitman, R. (red.). Springer, s. 140-149 Chapter 16. (Lecture Notes in Computer Science, Bind 11043).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Extraction of airway trees using multiple hypothesis tracking and template matching
Selvan, Raghav, Petersen, Jens, Pedersen, J. J. H. & de Bruijne, Marleen, 2016, The Sixth International Workshop on Pulmonary Image Analysis: Athens, Greece - October 21, 2016. Beichel, R. R., Farahani, K., Jacobs, C., Kabus, S., Kiraly, A. P., Kuhnigk, J-M., McClelland, J. R., Mori, K., Petersen, J. & Rit, S. (red.). Create Space Independent Publishing Platform, s. 43-54 12 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Extraction of Airways with Probabilistic State-Space Models and Bayesian Smoothing
Selvan, Raghav, Petersen, Jens, Pedersen, J. J. H. & de Bruijne, Marleen, 2017, Graphs in Biomedical Image Analysis, Computational Anatomy and Imaging Genetics: First International Workshop, GRAIL 2017, 6th International Workshop, MFCA 2017, and Third International Workshop, MICGen 2017, Held in Conjunction with MICCAI 2017, Québec City, QC, Canada, September 10–14, 2017, Proceedings. Cardoso, M. J., Arbel, T., Ferrante, E., Pennec, X., Dalca, A. V., Parisot, S., Joshi, S., Batmanghelich, N. K., Sotiras, A., Nielsen, M., Sabuncu, M. R., Fletcher, T., Shen, L., Durrleman, S. & Sommer, S. (red.). Springer, s. 53-63 (Lecture notes in computer science, Bind 10551).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Extraction of Airways using Graph Neural Networks
Selvan, Raghav, Kipf, T., Welling, M., Pedersen, J. J. H., Petersen, Jens & de Bruijne, Marleen, 2018. 3 s.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Extracting tree structures in CT data by tracking multiple statistically ranked hypotheses
Selvan, Raghav, Petersen, Jens, Pedersen, J. H. & de Bruijne, Marleen, 18 okt. 2019, I: Medical Physics. 46, 10, s. 4431-4440Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Emphysema progression is visually detectable in low-dose CT in continuous but not in former smokers
Wille, M. M. W., Thomsen, L. H., Dirksen, A., Petersen, Jens, Pedersen, J. J. H. & Shaker, S. B., 2014, I: European Radiology. 24, 11, s. 2692-2699 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of inspiration on airway dimensions measured in maximal inspiration CT images of subjects without airflow limitation
Petersen, Jens, Wille, M. M. W., Raket, L. L., Feragen, A., Pedersen, J. H., Nielsen, Mads, Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2014, I: European Radiology. 24, 9, s. 2319-2325 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dissimilarity-based classification of anatomical tree structures
Sørensen, L., Lo, P. C. P., Dirksen, A., Petersen, Jens & de Bruijne, Marleen, 2011, Information Processing in Medical Imaging: 22nd International Conference, IPMI 2011, Kloster Irsee, Germany, July 3-8, 2011. Proceedings. Székely, G. & Hahn, H. K. (red.). Springer, s. 475-485 11 s. (Lecture notes in computer science, Bind 6801).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diagnosis of bronchiectasis and airway wall thickening in children with cystic fibrosis: objective airway-artery quantification
Kuo, W., de Bruijne, Marleen, Petersen, Jens, Nasserinejad, K., Ozturk, H., Chen, Y., Perez-Rovira, A. & Tiddens, H. A. W. M., nov. 2017, I: European Radiology. 27, 11, s. 4680-4689 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Developing and validating COVID-19 adverse outcome risk prediction models from a bi-national European cohort of 5594 patients
Jimenez-Solem, E., Petersen, T. S., Hansen, C., Hansen, C., Lioma, C., Igel, C., Boomsma, W., Krause, O., Lorenzen, S., Selvan, R., Petersen, J., Nyeland, M. E., Ankarfeldt, M. Z., Virenfeldt, G. M., Winther-Jensen, M., Linneberg, A., Ghazi, M. M., Detlefsen, N., Lauritzen, A. D., Smith, A. G. & 15 flere, , 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 12 s., 3246.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Detecting emphysema with multiple instance learning
Orting, S. N., Petersen, Jens, Thomsen, L. H., Wille, M. M. W. & de Bruijne, Marleen, 23 maj 2018, 2018 IEEE 15th International Symposium on Biomedical Imaging, ISBI 2018. IEEE, s. 510-513Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
ID: 22733621
Flest downloads
-
2074
downloads
Geometric tree kernels: classification of COPD from airway tree geometry
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1972
downloads
A hierarchical scheme for geodesic anatomical labeling of airway trees
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1502
downloads
Quantitative airway analysis in longitudinal studies using groupwise registration and 4D optimal surfaces
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet