Jens Petersen
Lektor
Image Analysis, Computational Modelling and Geometry
Universitetsparken 1
2100 København Ø
- Udgivet
Geometric tree kernels: classification of COPD from airway tree geometry
Feragen, A., Petersen, Jens, Grimm, D., Dirksen, A., Pedersen, J. J. H., Borgwardt, K. & de Bruijne, Marleen, 2013, Information Processing in Medical Imaging: 23rd International Conference, IPMI 2013, Asilomar, CA, USA, June 28–July 3, 2013. Proceedings. Gee, J. C., Joshi, S., Pohl, K. M., Wells, W. M. & Zöllei, L. (red.). Springer, s. 171-183 13 s. (Lecture notes in computer science, Bind 7917).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Graph Refinement based Airway Extraction using Mean-Field Networks and Graph Neural Networks
Selvan, Raghav, Kipf, T., Welling, M., Juarez, A. G., Pedersen, J. H., Petersen, Jens & de Bruijne, Marleen, 2020, I: Medical Image Analysis. 64, 12 s., 101751.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Graph cut-based segmentation
Petersen, Jens, Oguz, I. & de Bruijne, Marleen, 2023, Medical Image Analysis. Academic Press, s. 247-273Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Harnessing data science to advance radiation oncology
Vogelius, Ivan R. , Petersen, Jens & Bentzen, S. M., 2020, I: Molecular Oncology. 14, 7, s. 1514–1528Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Increasing Accuracy of Optimal Surfaces Using Min-marginal Energies
Petersen, Jens, Arias-Lorza, A. M., Selvan, Raghav, Bos, D., van der Lugt, A., Pedersen, J. H., Nielsen, Mads & de Bruijne, Marleen, 1 jan. 2019, I: IEEE Transactions on Medical Imaging. 38, 7, s. 1559-1568 8599009.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interfractional dose accumulation for MR-guided liver SBRT: Variation among algorithms is highly patient- and fraction-dependent
Wahlstedt, I., Smith, Abraham George, Andersen, C. E., Behrens, C. P., Nørring Bekke, S., Boye, K., van Overeem Felter, M., Josipovic, Mirjana, Petersen, Jens, Risumlund, S. L., Tascón-Vidarte, J. D., van Timmeren, J. E. & Vogelius, Ivan R. , 2023, I: Radiotherapy and Oncology. 182, 9 s., 109448.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interobserver variability in visual evaluation of thoracic CT scans and comparison with automatic computer measurements of CT lung density
Wille, M. M. W., Thomsen, L. H., Petersen, Jens, Shaker, S. B., Dirksen, A. & Pedersen , J. H., 2012, I: European Respiratory Journal. 40, Supplement 56, s. 25s 1 s., P270.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interpreting Latent Spaces of Generative Models for Medical Images using Unsupervised Methods
Schön, Julian Elisha, Selvan, Raghav & Petersen, Jens, 2022, Deep Generative Models: Second MICCAI Workshop, DGM4MICCAI 2022, Held in Conjunction with MICCAI 2022, Singapore, September 22, 2022, Proceedings. Springer, s. 24-33 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 13609).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Learning to quantify emphysema extent: What labels do we need?
Orting, S. N., Petersen, Jens, Thomsen, L. H., Winkler Wille, M. M. & de Bruijne, Marleen, 2020, I: IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics. 24, 4, s. 1149 -1159Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Longitudinal analysis of airways using registration
Petersen, Jens, Gorbunova, V., Nielsen, Mads, Dirksen, A., Lo, P. C. P. & de Bruijne, Marleen, 2011, The Fourth International Workshop on Pulmonary Image Analysis. Beichel, R., de Bruijne, M., van Ginneken, B., Kabus, S., Kiraly, A., Kuhnigk, J-M., McClelland, J., Mori, K., van Rikxoort, E. & Rit, S. (red.). CreateSpace Independent Publishing Platform , s. 11-22 12 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Manual airway labeling has limited reproducibility
Petersen, Jens, Feragen, A., Thomsen, L. H., Wille, M. M. W., Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2013. 10 s.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Maximization of regional probabilities using Optimal Surface Graphs: application to carotid artery segmentation in MRI
Arias Lorza, A. M., Van Engelen, A., Petersen, Jens, Van Der Lugt, A. & de Bruijne, Marleen, 1 mar. 2018, I: Medical Physics. 45, 3, s. 1159-1169Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mean Field Network Based Graph Refinement with Application to Airway Tree Extraction
Selvan, Raghav, Welling, M., Pedersen, J. J. H., Petersen, Jens & de Bruijne, Marleen, 2018, Medical Image Computingand Computer AssistedIntervention – MICCAI 2018: 21st International Conference, Granada, Spain, September 16–20, 2018, Proceedings, Part II. Frangi, A. F., Schnabel, J. A., Davatzikos, C., Alberola-López, C. & Fichtinger, G. (red.). Springer, s. 750-758 (Lecture notes in computer science, Bind 11071).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Multisystem inflammatory syndrome in children occurred in one of four thousand children with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
Holm, M., Hartling, U. B., Schmidt, Lisbeth Samsø, Glenthøj, J. P., Kruse, A., Rytter, Maren Johanne Heilskov, Lindhard, M. S., Lawaetz, M. C., Zaharov, T., Petersen, Jens, Andersen, R. M., Lemvik, G., Marcinski, P., Thaarup, J., Jensen, Lise Heilmann, Borch, L., Nielsen, A. B., Vissing, N. H., Schmiegelow, Kjeld & Nygaard, Ulrikka, sep. 2021, I: Acta Paediatrica, International Journal of Paediatrics. 110, 9, s. 2581-2583 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Opfront: optimal front segmentation of images
Petersen, Jens, 2014Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Softwareprogram › Forskning
- Udgivet
Opfront: mesh
Petersen, Jens, 16 aug. 2015Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Softwareprogram › Forskning
- Udgivet
Optimal graph based segmentation using flow lines with application to airway wall segmentation
Petersen, Jens, Nielsen, Mads, Lo, P. C. P., Saghir, Z., Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2011, Information Processing in Medical Imaging: 22nd International Conference, IPMI 2011, Kloster Irsee, Germany, July 3-8, 2011. Proceedings. Székely, G. & Hahn, H. K. (red.). Springer, s. 49-60 12 s. (Lecture notes in computer science, Bind 6801).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Optimal surface segmentation using flow lines to quantify airway abnormalities in chronic obstructive pulmonary disease
Petersen, Jens, Nielsen, Mads, Lo, P. C. P., Nordenmark, L. H., Pedersen, J. J. H., Wille, M. M. W., Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2014, I: Medical Image Analysis. 18, 3, s. 531-541 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Patch-based Medical Image Segmentation using Matrix Product State Tensor Networks
Selvan, Raghav, Dam, Erik Bjørnager, Flensborg, S. A. & Petersen, Jens, 2022, I: The Journal of Machine Learning for Biomedical Imaging. 2022, s. 1-24 005.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population-based Incidence of Myopericarditis After COVID-19 Vaccination in Danish Adolescents
Nygaard, Ulrikka, Holm, M., Bohnstedt, Cathrine, Chai, Q., Schmidt, Lisbeth Samsø, Hartling, U. B., Petersen, Jens, Thaarup, J., Bjerre, J., Vejlstrup, N. G., Juul, K. & Stensballe, Lone Graff, jan. 2022, I: Pediatric Infectious Disease Journal. 41, 1, s. E25-E28 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Prediction of Radiation-induced Lymphopenia following Exposure of the Thoracic Region and Associated Risk of Infections and Mortality
Terrones-Campos, C., Ledergerber, B., Forbes, N., Smith, Abraham George, Petersen, Jens, Helleberg, Marie, Lundgren, Jens, Specht, Lena & Vogelius, Ivan R. , 2023, I: Clinical Oncology. 35, 7, s. e434-e444 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantification and visualization of variation in anatomical trees
Amenta, N., Datar, M., Dirksen, A., de Bruijne, Marleen, Feragen, A., Ge, X., Pedersen, J., Howard, M., Owen, M., Petersen, Jens, Shi, J. & Xu, Q., 2015, Research in shape modeling. Leonard, K. & Tari, S. (red.). Springer, s. 57-79 23 s. (Association for Women in Mathematics Series, Bind 1).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantifying emphysema extent from weakly labeled CT scans of the lungs using label proportions learning
Ørting, S. N., Petersen, Jens, Wille, M., Thomsen, L. & de Bruijne, Marleen, 2016, The Sixth International Workshop on Pulmonary Image Analysis. Beichel, R. R., Farahani, K., Jacobs, C., Kabus, S., Kiraly, A. P., Kuhnigk, J-M., McClelland, J. R., Mori, K., Petersen, J. & S. R. (red.). CreateSpace Independent Publishing Platform , s. 31-42 11 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantitative airway analysis in longitudinal studies using groupwise registration and 4D optimal surfaces
Petersen, Jens, Modat, M., Cardoso, M. J., Dirksen, A., Ourselin, S. & de Bruijne, Marleen, 2013, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2013: 16th International Conference, Nagoya, Japan, September 22-26, 2013, Proceedings, Part II. Mori, K., Sakuma, I., Sato, Y., Barillot, C. & Navab, N. (red.). Springer, Bind 2. s. 287-294 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 8150).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
ID: 22733621
Flest downloads
-
2074
downloads
Geometric tree kernels: classification of COPD from airway tree geometry
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1968
downloads
A hierarchical scheme for geodesic anatomical labeling of airway trees
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1502
downloads
Quantitative airway analysis in longitudinal studies using groupwise registration and 4D optimal surfaces
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet