Wouter Boomsma

Wouter Boomsma

Professor


  1. Udgivet

    3D steerable CNNs: Learning rotationally equivariant features in volumetric data

    Weiler, M., Geiger, M., Welling, M., Boomsma, Wouter & Cohen, T., 2018, Proceedings of the 32nd International Conference on Neural Information Processing Systems. derc udg. NIPS Proceedings, Bind 2018. s. 10381-10392 12 s. (Advances in Neural Information Processing Systems, Bind 31).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    A Monte Carlo study of the early steps of functional amyloid formation

    Tian, P., Lindorff-Larsen, Kresten, Boomsma, Wouter, Jensen, Mogens Høgh & Otzen, D. E., 2016, I: P L o S One. 11, 1, 18 s., e0146096.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. A comparison of adaptive operator scheduling methods on the traveling salesman problem

    Boomsma, Wouter, 2004, Evolutionary Computation in Combinatorial Optimization: 4th European Conference, EvoCOP 2004, Coimbra, Portugal, April 5-7, 2004. Proceedings. Gottlieb, J. & Raidl, G. R. (red.). Springer, s. 31-40 10 s. (Lecture notes in computer science, Bind 3004).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    A context-dependent and disordered ubiquitin-binding motif

    Dreier, Jesper Elmsted, Prestel, Andreas, Martins, J. M., Brøndum, S. S., Nielsen, Olaf, Garbers, Anna Engstrøm, Suga, H., Boomsma, Wouter, Rogers, Joseph Matthew, Hartmann-Petersen, Rasmus & Kragelund, Birthe Brandt, 2022, I: Cellular and molecular life sciences : CMLS. 79, 9, 21 s., 484.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    A generative, probabilistic model of local protein structure

    Boomsma, Wouter, Mardia, K. V., Taylor, C. C., Ferkinghoff-Borg, J., Krogh, Anders & Hamelryck, Thomas Wim, 2008, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 105, 26, s. 8932-8937 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    A probabilistic approach to protein structure prediction: PHAISTOS in CASP8

    Borg, M., Boomsma, Wouter, Ferkinghoff-Borg, J., Frellsen, J., Harder, T. P., Mardia, K., Røgen, P., Stovgaard, K. & Hamelryck, Thomas Wim, 2009, LASR 2009 — Statistical Tools for Challenges in Bioinformatics. Proceedings. Gusnanto, A., Mardia, K. V. & Fallaize, C. J. (red.). University of Leeds, s. 65-70 6 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    A probabilistic approach to protein structureprediction: PHAISTOS in CASP8

    Borg, M., Boomsma, Wouter, Ferkinghoff-Borg, J., Frellsen, J., Harder, T. P., Mardia, K. V., Røgen, P., Stovgaard, K. & Hamelryck, Thomas Wim, 2009, I: School of Mathematics. s. 65-70

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    A sticky cage can slow down folding

    Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2013, I: Biophysical Journal. 104, 5, s. 964-965 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskning

  9. Udgivet

    Adaptive Cholesky Gaussian Processes

    Bartels, S., Stensbo-Smidt, K., Moreno-Muñoz, P., Boomsma, Wouter, Frellsen, J. & Hauberg, S., 2023, I: Proceedings of Machine Learning Research. 206, s. 408--452 44 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    An efficient null model for conformational fluctuations in proteins

    Harder, T. P., Bottaro, S., Boomsma, Wouter, Olsson, S., Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2012, I: Structure. 20, 6, s. 1028-1039 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Ancient biomolecules from deep ice cores reveal a forested southern Greenland.

    Willerslev, E., Cappellini, E., Boomsma, W. K., Nielsen, R., Hebsgaard, M. B., Brand, T. B., Hofreiter, M., Bunce, M., Poinar, H. N., Dahl-Jensen, D., Johnsen, S. J., Steffensen, J. P., Bennike, O., Schwenninger, J-L., Nathan, R., Armitage, S., de Hoog, C-J., Alfimov, V., Christl, M., Beer, J. & 10 flere, Muscheler, R., Barker, J., Sharp, M., Penkman, K. E. H., Haile, J., Taberlet, P., Gilbert, M Thomas P, Casoli, A., Campani, E. & Collins, M. J., 2007, I: Science. 317, 5834, s. 111-114 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Barnaba: software for analysis of nucleic acid structures and trajectories

    Bottaro, S., Bussi, G., Pinamonti, G., Reisser, S., Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2019, I: RNA. 25, 2, s. 219-231

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Bayesian inference of protein ensembles from SAXS data

    Antonov, L. D., Olsson, S., Boomsma, Wouter & Hamelryck, Thomas Wim, 2016, I: Physical Chemistry Chemical Physics. 18, 8, s. 5832-5838 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Beyond rotamers: a generative, probabilistic model of side chains in proteins

    Harder, T., Boomsma, Wouter, Paluszewski, M., Frellsen, J., Johansson, Kristoffer Enøe & Hamelryck, Thomas Wim, 1 jan. 2010, I: B M C Bioinformatics. 11, s. 306

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Bioinformatics analysis identifies several intrinsically disordered human E3 ubiquitin-protein ligases

    Boomsma, Wouter, Nielsen, S. V., Lindorff-Larsen, Kresten, Hartmann-Petersen, Rasmus & Ellgaard, Lars, 2016, I: PeerJ. 4, 18 s., e1725.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Combining experiments and simulations using the maximum entropy principle

    Boomsma, Wouter, Ferkinghoff-Borg, J. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2014, I: PLoS Computational Biology. 10, 2, 9 s., e1003406.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Comparing molecular dynamics force fields in the essential subspace

    Martin-García, F., Papaleo, E., Gomez-Puertas, P., Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: PLoS ONE. 10, 3, 16 s., e0121114.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Conformational and aggregation properties of the 1-93 fragment of apolipoprotein A-I

    Petrlova, J., Bhattacherjee, A., Boomsma, Wouter, Wallin, S., Lagerstedt, J. O. & Irbäck, A., 2014, I: Protein Science. 23, 11, s. 1559-1571 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Context Matters in Disorder Based Protein Communication

    Kragelund, Birthe Brandt, Prestel, Andreas, Wickmann, N., Martins, J., Boomsma, Wouter, Staby, L., Hendus-Altenburger, R. & Skriver, Karen, 2020, I: Biophysical Journal. 118, 3, suppl. 1, s. 491A 2407-Plat.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Developing and validating COVID-19 adverse outcome risk prediction models from a bi-national European cohort of 5594 patients

    Jimenez-Solem, E., Petersen, T. S., Hansen, C., Hansen, C., Lioma, C., Igel, C., Boomsma, W., Krause, O., Lorenzen, S., Selvan, R., Petersen, J., Nyeland, M. E., Ankarfeldt, M. Z., Virenfeldt, G. M., Winther-Jensen, M., Linneberg, A., Ghazi, M. M., Detlefsen, N., Lauritzen, A. D., Smith, A. G. & 15 flere, de Bruijne, Marleen, Ibragimov, Bulat, Petersen, Jens, Lillholm, Martin, Middleton, Jon Anthony, Mogensen, S. H., Thorsen-Meyer, H., Perner, Anders, Helleberg, M., Kaas-Hansen, Benjamin Skov, Bonde, M., Bonde, A., Pai, A., Nielsen, Mads & Sillesen, Martin Hylleholt, 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 12 s., 3246.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Driving Structural Transitions in Molecular Simulations Using the Nonequilibrium Candidate Monte Carlo

    Kurut, A., Fonseca, R. & Boomsma, Wouter, 25 jan. 2018, I: Journal of Physical Chemistry Part B: Condensed Matter, Materials, Surfaces, Interfaces & Biophysical. 122, 3, s. 1195-1204

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    ENCORE: Software for Quantitative Ensemble Comparison

    Tiberti, M., Papaleo, E., Bengtsen, T., Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: PLoS Computational Biology. 11, 10, 16 s., e1004415.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Efficient, non-disruptive local moves for Monte Carlo sampling of proteins

    Bottaro, S., Boomsma, Wouter, Johansson, Kristoffer Enøe, Andreetta, C., Hamelryck, Thomas Wim & Ferkinghoff-Borg, J., 2011, Next Generation Statistics in Biosciences: Proceedings of the 30th Leeds Annual Statistical Research (LASR) Workshop. Mardia, K. V., Gusnanto, A., Riley, A. D. & Voss, J. (red.). University of Leeds, s. 127 1 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferenceabstrakt i proceedingsForskning

  24. Udgivet

    Equilibrium simulations of proteins using molecular fragment replacement and NMR chemical shifts

    Boomsma, Wouter, Tian, P., Frellsen, J., Ferkinghoff-Borg, J., Hamelryck, Thomas Wim, Lindorff-Larsen, Kresten & Vendruscolo, M., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 38, s. 13852-13857 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Fast large-scale clustering of protein structures using Gauss integrals

    Harder, T. P., Borg, M., Boomsma, Wouter, Røgen, P. & Hamelryck, Thomas Wim, 2012, I: Bioinformatics. 28, 4, s. 510-515 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 40103911