Jens Petersen
Lektor
Image Analysis, Computational Modelling and Geometry
Universitetsparken 1
2100 København Ø
- 2023
- Udgivet
Reproducibility of a combined artificial intelligence and optimal-surface graph-cut method to automate bronchial parameter extraction
Dudurych, I., Garcia-Uceda, A., Petersen, Jens, Du, Y., Vliegenthart, R. & de Bruijne, Marleen, 2023, I: European Radiology. 33, s. 6718–6725Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Graph cut-based segmentation
Petersen, Jens, Oguz, I. & de Bruijne, Marleen, 2023, Medical Image Analysis. Academic Press, s. 247-273Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Prediction of Radiation-induced Lymphopenia following Exposure of the Thoracic Region and Associated Risk of Infections and Mortality
Terrones-Campos, C., Ledergerber, B., Forbes, N., Smith, Abraham George, Petersen, Jens, Helleberg, Marie, Lundgren, Jens, Specht, Lena & Vogelius, Ivan R. , 2023, I: Clinical Oncology. 35, 7, s. e434-e444 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interfractional dose accumulation for MR-guided liver SBRT: Variation among algorithms is highly patient- and fraction-dependent
Wahlstedt, I., Smith, Abraham George, Andersen, C. E., Behrens, C. P., Nørring Bekke, S., Boye, K., van Overeem Felter, M., Josipovic, Mirjana, Petersen, Jens, Risumlund, S. L., Tascón-Vidarte, J. D., van Timmeren, J. E. & Vogelius, Ivan R. , 2023, I: Radiotherapy and Oncology. 182, 9 s., 109448.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
Population-based Incidence of Myopericarditis After COVID-19 Vaccination in Danish Adolescents
Nygaard, Ulrikka, Holm, M., Bohnstedt, Cathrine, Chai, Q., Schmidt, Lisbeth Samsø, Hartling, U. B., Petersen, Jens, Thaarup, J., Bjerre, J., Vejlstrup, N. G., Juul, K. & Stensballe, Lone Graff, jan. 2022, I: Pediatric Infectious Disease Journal. 41, 1, s. E25-E28 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interpreting Latent Spaces of Generative Models for Medical Images using Unsupervised Methods
Schön, Julian Elisha, Selvan, Raghav & Petersen, Jens, 2022, Deep Generative Models: Second MICCAI Workshop, DGM4MICCAI 2022, Held in Conjunction with MICCAI 2022, Singapore, September 22, 2022, Proceedings. Springer, s. 24-33 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 13609).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Patch-based Medical Image Segmentation using Matrix Product State Tensor Networks
Selvan, Raghav, Dam, Erik Bjørnager, Flensborg, S. A. & Petersen, Jens, 2022, I: The Journal of Machine Learning for Biomedical Imaging. 2022, s. 1-24 005.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RootPainter: deep learning segmentation of biological images with corrective annotation
Smith, Abraham George, Han, Eusun, Petersen, Jens, Olsen, N. A. F., Giese, C., Athmann, M., Dresbøll, Dorte Bodin & Thorup-Kristensen, Kristian, 2022, I: New Phytologist. 236, s. 774-791 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RootPainter3D: Interactive-machine-learning enables rapid and accurate contouring for radiotherapy
Smith, Abraham George, Petersen, Jens, Terrones-Campos, C., Berthelsen, A. K., Forbes, N. J., Darkner, Sune, Specht, Lena & Vogelius, I. R., 2022, I: Medical Physics. 49, 1, s. 461-473Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Multisystem inflammatory syndrome in children occurred in one of four thousand children with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
Holm, M., Hartling, U. B., Schmidt, Lisbeth Samsø, Glenthøj, J. P., Kruse, A., Rytter, Maren Johanne Heilskov, Lindhard, M. S., Lawaetz, M. C., Zaharov, T., Petersen, Jens, Andersen, R. M., Lemvik, G., Marcinski, P., Thaarup, J., Jensen, Lise Heilmann, Borch, L., Nielsen, A. B., Vissing, N. H., Schmiegelow, Kjeld & Nygaard, Ulrikka, sep. 2021, I: Acta Paediatrica, International Journal of Paediatrics. 110, 9, s. 2581-2583 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Developing and validating COVID-19 adverse outcome risk prediction models from a bi-national European cohort of 5594 patients
Jimenez-Solem, E., Petersen, T. S., Hansen, C., Hansen, C., Lioma, C., Igel, C., Boomsma, W., Krause, O., Lorenzen, S., Selvan, R., Petersen, J., Nyeland, M. E., Ankarfeldt, M. Z., Virenfeldt, G. M., Winther-Jensen, M., Linneberg, A., Ghazi, M. M., Detlefsen, N., Lauritzen, A. D., Smith, A. G. & 15 flere, , 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 12 s., 3246.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Segmenting Two-Dimensional Structures with Strided Tensor Networks
Selvan, Raghav, Dam, Erik Bjørnager & Petersen, Jens, 2021, Information Processing in Medical Imaging - 27th International Conference, IPMI 2021, Proceedings. Feragen, A., Sommer, S., Schnabel, J. & Nielsen, M. (red.). Springer, s. 401-414 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 12729 LNCS).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Learning to quantify emphysema extent: What labels do we need?
Orting, S. N., Petersen, Jens, Thomsen, L. H., Winkler Wille, M. M. & de Bruijne, Marleen, 2020, I: IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics. 24, 4, s. 1149 -1159Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Graph Refinement based Airway Extraction using Mean-Field Networks and Graph Neural Networks
Selvan, Raghav, Kipf, T., Welling, M., Juarez, A. G., Pedersen, J. H., Petersen, Jens & de Bruijne, Marleen, 2020, I: Medical Image Analysis. 64, 12 s., 101751.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Segmentation of roots in soil with U-Net
Smith, Abraham George, Petersen, Jens, Selvan, Raghav & Rasmussen, Camilla Ruø, 2020, I: Plant Methods. 16, s. 1-15 13.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Chronic Obstructive Pulmonary Disease Quantification Using CT Texture Analysis and Densitometry: Results From the Danish Lung Cancer Screening Trial
Sørensen, L., Nielsen, Mads, Petersen, Jens, Pedersen, J. H., Dirksen, A. & de Bruijne, Marleen, 2020, I: American Journal of Roentgenology. 214, 6, s. 1269-1279Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Harnessing data science to advance radiation oncology
Vogelius, Ivan R. , Petersen, Jens & Bentzen, S. M., 2020, I: Molecular Oncology. 14, 7, s. 1514–1528Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
- Udgivet
A Cross-Center Smoothness Prior for Variational Bayesian Brain Tissue Segmentation
Kouw, W. M., Ørting, S. N., Petersen, Jens, Steenstrup Pedersen, Kim & de Bruijne, Marleen, 1 jan. 2019, Information Processing in Medical Imaging : 26th International Conference, IPMI 2019, Proceedings. Bao, S., Chung, A. C. S., Gee, J. C. & Yushkevich, P. A. (red.). Springer, s. 360-371 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 11492 LNCS).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Increasing Accuracy of Optimal Surfaces Using Min-marginal Energies
Petersen, Jens, Arias-Lorza, A. M., Selvan, Raghav, Bos, D., van der Lugt, A., Pedersen, J. H., Nielsen, Mads & de Bruijne, Marleen, 1 jan. 2019, I: IEEE Transactions on Medical Imaging. 38, 7, s. 1559-1568 8599009.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Extracting tree structures in CT data by tracking multiple statistically ranked hypotheses
Selvan, Raghav, Petersen, Jens, Pedersen, J. H. & de Bruijne, Marleen, 18 okt. 2019, I: Medical Physics. 46, 10, s. 4431-4440Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
Maximization of regional probabilities using Optimal Surface Graphs: application to carotid artery segmentation in MRI
Arias Lorza, A. M., Van Engelen, A., Petersen, Jens, Van Der Lugt, A. & de Bruijne, Marleen, 1 mar. 2018, I: Medical Physics. 45, 3, s. 1159-1169Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Semi-automated detection of pulmonary congestion in patients with non-ST acute coronary syndrome by using of quantitative chest cardiac-CT analysis: Analysis of methodological aspects
Fabricius-Bjerre, A. A., Petersen, Jens, Heitmann, Merete, Elming, H., Ashraf, H., Kofoed, Klaus Fuglsang, Kuhl, J. T., Køber, Lars Valeur & Nielsen, Olav Wendelboe, 2018, I: European Journal of Heart Failure. 20, S1, s. 475-476 P1854.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Feature Learning Based on Visual Similarity Triplets in Medical Image Analysis: A Case Study of Emphysema in Chest CT Scans
Nyboe Ørting, S., Petersen, Jens, Cheplygina, V., Thomsen, L. H., Wille, M. M. W. & de Bruijne, Marleen, 2018, Intravascular Imaging and Computer Assisted Stenting and Large-Scale Annotation of Biomedical Data and Expert Label Synthesis: 7th Joint International Workshop, CVII-STENT 2018 and Third International Workshop, LABELS 2018 Held in Conjunction with MICCAI 2018 Granada, Spain, September 16, 2018 Proceedings. Stoyanov, D., Taylor, Z., Balocco, S. & Sznitman, R. (red.). Springer, s. 140-149 Chapter 16. (Lecture Notes in Computer Science, Bind 11043).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Detecting emphysema with multiple instance learning
Orting, S. N., Petersen, Jens, Thomsen, L. H., Wille, M. M. W. & de Bruijne, Marleen, 23 maj 2018, 2018 IEEE 15th International Symposium on Biomedical Imaging, ISBI 2018. IEEE, s. 510-513Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
ID: 22733621
Flest downloads
-
2077
downloads
Geometric tree kernels: classification of COPD from airway tree geometry
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1974
downloads
A hierarchical scheme for geodesic anatomical labeling of airway trees
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1502
downloads
Quantitative airway analysis in longitudinal studies using groupwise registration and 4D optimal surfaces
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet