Jon Sporring
Professor
Image Analysis, Computational Modelling and Geometry
Universitetsparken 1
2100 København Ø
- 2024
- Udgivet
A semi-automatic method for extracting mitochondrial cristae characteristics from 3D focused ion beam scanning electron microscopy data
Wang, C., Østergaard, L., Hasselholt, S. & Sporring, Jon, 2024, I: Communications Biology . 7, 1, 377.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Young glial progenitor cells competitively replace aged and diseased human glia in the adult chimeric mouse brain
Vieira, R., Mariani, J. N., Huynh, N. P. T., Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Solly, R., Tate, A., Schanz, S., Cotrupi, N., Mousaei, M., Sporring, Jon, Benraiss, A. & Goldman, Steven Alan, 2024, I: Nature Biotechnology. 42, s. 719-730 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
Parametric Volumetric Registration
Yushkevich, P. A., Zhang, M. & Sporring, Jon, 29 sep. 2023, Medical Image Analysis. Frangi, A., Prince, J. & Sonka, M. (red.). Academic Press, s. 331-354 24 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A Practical Approach to Estimating the Effect of Synchrotron Radiation on Sperm Motility and Viability
Lindhøj, M. B., Bonnin, A., Almstrup, K., Dyrby, T., Mokso, R. & Sporring, Jon, 2023, bioRxiv, 18 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
Astrocytic engagement of the corticostriatal synaptic cleft is disrupted in a mouse model of Huntington’s disease
Villanueva, C. B., Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Mokso, R., Benraiss, A., Sporring, Jon & Goldman, Steven Alan, 2023, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 120, 24, 11 s., e2210719120.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Morphology on Categorical Distributions
Ørting, S. N., Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg & Sporring, Jon, 2023, I: Journal of Mathematical Imaging and Vision. 65, s. 861–873Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multi-scale and Multi-resolution
Sporring, Jon, 2023, Medical Image Analysis. Frangi, A., Prince, J. & Sonka, M. (red.). Elsevier, 33 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multiscale and multiresolution analysis
Sporring, Jon, 2023, Medical Image Analysis. Academic Press, s. 177-197Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
Extracting Mitochondrial Cristae Characteristics from 3D Focused Ion Beam Scanning Electron Microscopy Data
Wang, C., Østergård, L., Hasselholt, S. & Sporring, Jon, 9 nov. 2022, bioRxiv. 20 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport › Forskning
- Udgivet
Reconstructing Binary Signals from Local Histograms
Sporring, Jon & Darkner, Sune, 21 mar. 2022, I: Entropy. 24, 3, s. 1-11 433.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An algebra for local histograms
Sporring, Jon & Darkner, Sune, 2022, I: Frontiers in Computer Science. 4, s. 1-9 939563.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Layer III pyramidal cells in the prefrontal cortex reveal morphological changes in subjects with depression, schizophrenia, and suicide
Larsen, N. Y., Vihrs, N., Møller, J., Sporring, Jon, Tan, X., Li, X., Ji, G., Rajkowska, G., Sun, F. & Nyengaard, J. R., 2022, I: Translational Psychiatry. 12, 1, s. 363 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Cellular 3D-reconstruction and analysis in the human cerebral cortex using automatic serial sections
Larsen, N. Y., Li, X., Tan, X., Ji, G., Lin, J., Rajkowska, G., Møller, J., Vihrs, N., Sporring, Jon, Sun, F. & Nyengaard, J. R., dec. 2021, I: Communications Biology . 4, 1, 15 s., 1030.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Currents and K-functions for Fiber Point Processes
Hansen, P. E. H., Waagepetersen, R. P., Svane, A. M., Sporring, Jon, Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Hasselholt, S. & Sommer, Stefan Horst, 2021, arXiv preprint. 12 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport › Forskning
- Udgivet
Currents and K-functions for Fiber Point Processes
Hansen, P. E. H., Waagepetersen, R. P., Svane, A. M., Sporring, Jon, Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Hasselholt, S. & Sommer, Stefan Horst, 2021, Geometric Science of Information: 5th International Conference, GSI 2021, Paris, France, July 21–23, 2021, Proceedings. Nielsen, F. & Barbaresco, F. (red.). Springer, s. 127-134 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 12829).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
How Few Annotations are Needed for Segmentation Using a Multi-planar U-Net?
Laprade, W. M., Perslev, Mathias & Sporring, Jon, 2021, Deep Generative Models, and Data Augmentation, Labelling, and Imperfections - First Workshop, DGM4MICCAI 2021, and First Workshop, DALI 2021, Held in Conjunction with MICCAI 2021, Proceedings. Engelhardt, S., Oksuz, I., Zhu, D., Yuan, Y., Mukhopadhyay, A., Heller, N., Huang, S. X., Nguyen, H., Sznitman, R. & Xue, Y. (red.). Springer, s. 209-216 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 13003 LNCS).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Measuring Shape Relations Using r-Parallel Sets
Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Svane, A. M., Villanueva, C. B., Goldman, Steven Alan & Sporring, Jon, 2021, I: Journal of Mathematical Imaging and Vision. 63, s. 1069–1083 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Morphology on categorical distributions
Ørting, S. N., Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg & Sporring, Jon, 14 dec. 2020, arXiv.org.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport › Forskning
- Udgivet
- Udgivet
A Novel Approach to Tongue Standardization and Feature Extraction
Wang, C., Cattaneo, C., Liu, J., Bredie, Wender, Pagliarini, E. & Sporring, Jon, 2020, Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2020: 23rd International Conference, Proceedings. Martel, A. L., Abolmaesumi, P., Stoyanov, D., Mateus, D., Zuluaga, M. A., Zhou, S. K., Racoceanu, D. & Joskowicz, L. (red.). Springer, s. 36-45 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 12265 LNCS).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparison of manual and machine learning image processing approaches to determine fungiform papillae on the tongue
Cattaneo, C., Liu, J., Wang, C., Pagliarini, E., Sporring, Jon & Bredie, Wender, 2020, bioRxiv, 18 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
Comparison of manual and machine learning image processing approaches to determine fungiform papillae on the tongue
Cattaneo, C., Liu, J., Wang, C., Pagliarini, E., Sporring, Jon & Bredie, Wender, 2020, I: Scientific Reports. 10, 15 s., 18694.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Restoring drifted electron microscope volumes using synaptic vesicles at sub-pixel accuracy
Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2020, I: Communications Biology. 3, 1, 7 s., ´81.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
- Udgivet
Drift Corrector Software
Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Darkner, Sune & Sporring, Jon, 20 aug. 2019Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Softwareprogram › Forskning
- Udgivet
Using a high-level parallel programming language for GPU-accelerated tomographic reconstruction
Lindhøj, M. B., Henriksen, Troels, Pedersen, L. & Sporring, Jon, 15 jul. 2019, The 2019 International Conference on High Performance Computing & Simulation: HPCS 2019. IEEE, s. 27-32 6 s. 3Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Generalizations of Ripley’s K-function with Application to Space Curves
Sporring, Jon, Waagepetersen, R. P. & Sommer, Stefan Horst, jun. 2019, Information Processing in Medical Imaging - 26th International Conference, IPMI 2019, Hong Kong, China, 2019, Proceedings: 26th International Conference, IPMI 2019, Hong Kong, China, June 2–7, 2019, Proceedings. Springer, s. 731-742 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 11492).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Experimental cerebral malaria is associated with profound loss of both glycan and protein components of the endothelial glycocalyx
Hempel, C., Sporring, Jon & Kurtzhals, Jørgen, 2019, I: F A S E B Journal. 33, 2, s. 2058-2071Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Muscle fibre morphology and microarchitecture in cerebral palsy patients obtained by 3D synchrotron X-ray computed tomography
Borg, L., Sporring, Jon, Dam, Erik Bjørnager, Dahl, V. A., Dyrby, T. B., Feidenhans'l, Robert Krarup, Dahl, A. B. & Pingel, Jessica, 2019, I: Computers in Biology and Medicine. 107, s. 265-269 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
Collocation for diffeomorphic deformations in medical image registration
Darkner, Sune, Pai, A. S. U., Liptrot, M. G. & Sporring, Jon, 2018, I: I E E E Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 40, 7, s. 1570-1583Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Estimating the continuous entropy of a discrete set of orientations in R3
Sporring, Jon, 2018, Copenhagen: Department of Computer Science, University of Copenhagen. 6 s. (Technical Report; Nr. 1, Bind 2018).Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport › Forskning
- 2017
- Udgivet
Reduction of variable-truncation artifacts from beam occlusion during in situ x-ray tomography
Borg, L., Jørgensen, J. S., Frikel, J. & Sporring, Jon, dec. 2017, I: Measurement Science and Technology. 28, 12, 19 s., 124004.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Synchrotron radiation μCT and histology evaluation of bone-to-implant contact
Neldam, C. A., Sporring, Jon, Rack, A., Lauridsen, T., Hauge, E. M., Jørgensen, H. L., Jørgensen, Niklas Rye, Feidenhans'l, Robert Krarup & Pinholt, E. M., sep. 2017, I: Journal of Cranio-Maxillofacial Surgery. 45, 9, s. 1448-1457 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Towards characterizing and reducing artifacts caused by varying projection truncation
Borg, L., Jørgensen, J. S. & Sporring, Jon, 24 feb. 2017, Department of Computer Science, University of Copenhagen. 42 s. (Datalogisk Institut. Københavns Universitet. Technical Reports; Nr. 1, Bind 2017).Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport › Forskning
- Udgivet
3D analysis of synaptic vesicle density and distribution after acute foot-shock stress by using serial section transmission electron microscopy
Khanmohammadi, M., Darkner, Sune, Nava, N., Nyengaard, J. R., Wegener, G., Popoli, M. & Sporring, Jon, 2017, I: Journal of Microscopy. 265, 1, s. 101–110 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
3D estimation of synaptic vesicle distributions in serial section transmission electron microscopy
Khanmohammadi, M., Darkner, Sune, Nava, N., Nyengaard, J. R., Wegener, G., Popoli, M. & Sporring, Jon, 2017, I: Journal of Microscopy. 265, 1, s. 101–110 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Estimation of sample spacing in stochastic processes
Rønn-Nielsen, A., Sporring, Jon & Jensen, E. B. V., 2017, I: Image Analysis and Stereology. 36, 1, s. 43-49 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reducing artifacts from varying projection truncations
Borg, L., Jørgensen, J. S., Frikel, J., Quinto, E. T. & Sporring, Jon, 2017. 2 s.Publikation: Konferencebidrag › Paper › Forskning › fagfællebedømt
- 2016
- Udgivet
Combining the boundary shift integral and tensor-based morphometry for brain atrophy estimation
Michalkiewicz, M. D., Pai, A. S. U., Leung, K. K., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sørensen, L., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2016, Medical imaging 2016: Image processing. Styner, M. A. & Angelini, E. D. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 6 s. 978406. (Progress in Biomedical Optics and Imaging).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Deformation-based atrophy computation by surface propagation and its application to Alzheimer’s disease
Pai, A. S. U., Sporring, Jon, Darkner, Sune, Dam, Erik Bjørnager, Lillholm, Martin, Jørgensen, D., Oh, J., Chen, G., Suhy, J., Sørensen, L. & Nielsen, Mads, 2016, I: SPIE Journal of Medical Imaging. 3, 1, 11 s., 014005.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Kernel bundle diffeomorphic image registration using stationary velocity fields and Wendland basis functions
Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2016, I: IEEE Transactions on Medical Imaging. 35, 6, s. 1369-1380 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Recovery of missing information in diffusion magnetic resonance imaging data
Siddiqi, K., Piuze-Phaneuf, E. & Sporring, Jon, 2016, Patentnr. US 2016/0335786 A1, 17 nov. 2016Publikation: Patent
- 2015
- Udgivet
Adaptive time-stepping in dieomorphic image registration with bounded inverse consistency error
Pai, A. S. U., Klein, S., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, Proceedings of the fifth international workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA 2015) . INRIA, s. 35-47Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Adaptive time-stepping in diffeomorphic image registration with bounded inverse consistency error
Pai, A. S. U., Klein, S., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L. E. B. L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, The 18th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention: proceedings. Technische Universität München , s. 35-47 13 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Analysis of shape and spatial interaction of synaptic vesicles using data from focused ion beam scanning electron microscopy (FIB-SEM)
Khanmohammadi, M., Waagepetersen, R. P. & Sporring, Jon, 2015, I: Frontiers in Neuroanatomy. 9, 11 s., 116.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparison of several computational pipelines for atrophy computation in longitudinal Alzheimers studies
Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sørensen, L. E. B. L., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Connection forms for beating the heart
Mensch, A., Piuze, E., Lehnert, L., Backermans, A. J., Sporring, Jon, Strijkers, G. J. & Siddiqi, K., 2015, Statistical Atlases and Computational Models of the Heart - Imaging and Modelling Challenges: 5th International Workshop, STACOM 2014, Held in Conjunction with MICCAI 2014, Boston, MA, USA, September 18, 2014, Revised Selected Papers. Camara, O., Mansi, T., Pop, M., Rhode, K., Sermesant, M. & Young, A. (red.). Springer, s. 83-92 10 s. (Lecture notes in computer science, Bind 8896).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diffeomorphic image registration with automatic time-step adjustment
Pai, A. S. U., Klein, S., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, 2015 IEEE 12th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI). IEEE, s. 1085-1088 4 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Image registration using stationary velocity fields parameterized by norm-minimizing Wendland kernel
Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, Medical Imaging 2015: Image Processing. SPIE - International Society for Optical Engineering, 7 s. (Proceedings of S P I E - International Society for Optical Engineering, Bind 9413).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Matematik på hjertet: bedre diagnosticering af hjertesygdomme
Sporring, Jon, 2015, Naturen i computeren. Det Natur- og Biovidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet, s. 12-13 2 s. (Temahæfte, Bind 2015).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Undervisning
- Udgivet
Maurer-cartan forms for fields on surfaces: application to heart fiber geometry
Piuze, E., Sporring, Jon & Siddiqi, K., 2015, I: IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 37, 12, s. 2492-2504 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 13303
Flest downloads
-
6261
downloads
Virtual Trackballs Revisited
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
5779
downloads
Locally orderless registration
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3749
downloads
Information measures in scale-spaces
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet