Thomas Wim Hamelryck

Thomas Wim Hamelryck

Professor


  1. 2018
  2. Udgivet

    Toroidal Diffusions and Protein Structure Evolution

    Garcia Portugues, E., Golden, M., Sørensen, Michael, Mardia, K. V., Hamelryck, Thomas Wim & Hein, J., 2018, Applied Directional Statistics: Modern Methods and Case Studies. Ley, C. & Verdebout, H. (red.). CRC Press, 34 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  3. 2019
  4. Udgivet

    A Probabilistic Programming Approach to Protein Structure Superposition

    Sanz Moreta, Lys, Al-Sibahi, A. S., Theobald, D., Bullock, W., Rommes, B. N., Manoukian, Andreas & Hamelryck, Thomas Wim, 2019, 2019 IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology, CIBCB 2019. Baruzzo, G., Daberdaku, S., Di Camillo, B., Furini, S., Giordano, E. D. & Nicosia, G. (red.). IEEE, 5 s. 8791469

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Langevin diffusions on the torus: estimation and applications

    García-Portugués, E., Sørensen, Michael, Mardia, K. V. & Hamelryck, Thomas Wim, 2019, I: Statistics and Computing. 29, 1, s. 1-22 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. 2020
  7. Udgivet

    A community proposal to integrate structural bioinformatics activities in ELIXIR (3D-Bioinfo Community) [version 1; peer review: 1 approved, 3 approved with reservations]

    Orengo, C., Velankar, S., Wodak, S., Zoete, V., Bonvin, A. M. J. J., Elofsson, A., Feenstra, K. A., Gerloff, D. L., Hamelryck, T., Hancock, J. M., Helmer-Citterich, M., Hospital, A., Orozco, M., Perrakis, A., Rarey, M., Soares, C., Sussman, J. L., Thornton, J. M., Tuffery, P., Tusnady, G. & 3 flere, Wierenga, R., Salminen, T. & Schneider, B., 2020, I: F1000Research. 9, 27 s., 278.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    GISA: using Gauss Integrals to identify rare conformations in protein structures

    Grønbæk, Christian, Hamelryck, Thomas Wim & Røgen, P., 2020, I: PeerJ. 8, 16 s., e9159.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Bayesian protein superposition using Hamiltonian Monte Carlo

    Sanz Moreta, Lys, Al-Sibahi, A. S. & Hamelryck, Thomas Wim, okt. 2020, Proceedings - IEEE 20th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering, BIBE 2020. IEEE, s. 1-11 9288019

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  10. 2021
  11. Udgivet

    Efficient Generative Modelling of Protein Structure Fragments using a Deep Markov Model

    Thygesen, Christian Bahne, Al-Sibahi, A. S., Steenmanns, C. S., Sanz Moreta, Lys, Sørensen, A. B. & Hamelryck, Thomas Wim, 2021, International Conference on Machine Learning, 18-24 July 2021, Virtual. PMLR, s. 10258-10267 (Proceedings of Machine Learning Research, Bind 139).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Time-efficient Bayesian Inference for a (Skewed) von Mises Distribution on the Torus in a Deep Probabilistic Programming Language

    Rønning, Ola, Ley, C., Mardia, K. V. & Hamelryck, Thomas Wim, 2021, 2021 IEEE International Conference on Multisensor Fusion and Integration for Intelligent Systems (MFI). IEEE, s. 1-8

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  13. 2022
  14. Udgivet

    Mixture Models for Spherical Data with Applications to Protein Bioinformatics

    Mardia, K. V., Barber, S., Burdett, P. M., Kent, J. T. & Hamelryck, Thomas Wim, 2022, Directional Statistics for Innovative Applications: A Bicentennial Tribute to Florence Nightingale. Springer, s. 15-32 (Forum for Interdisciplinary Mathematics).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Persistent Topology of Protein Space

    Hamilton, W., Borgert, J. E., Hamelryck, Thomas Wim & Marron, J. S., 2022, Research in Computational Topology 2. Springer, s. 223-244 (Association for Women in Mathematics Series, Bind 30).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

ID: 5765