Thomas Wim Hamelryck

Thomas Wim Hamelryck

Professor

ORCID: 0000-0003-2917-3602

Udgivelsesår:
Alle
1 - 25 ud af 62Pr. side: 25
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2005
  2. Udgivet

    Evolving hidden Markov models for protein secondary structure prediction

    Won, K. J., Hamelryck, Thomas Wim, Prügel-Bennett, A. & Krogh, Anders, 2005, The 2005 IEEE Congress on Evolutionary Computation, IEEE CEC 2005: Proceedings. IEEE, Bind 3. s. 33-40 8 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    Full cyclic coordinate descent: solving the protein loop closure problem in Cα space

    Boomsma, Wouter & Hamelryck, Thomas Wim, 2005, I: BMC Bioinformatics. 6, 10 s., 159.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. 2006
  5. Udgivet

    Diverse bacterial genomes encode an operon of two genes, one of which is a unusual class-I release factor that potentially recognizes atypical mRNA signals other than normal stop codons

    Baranov, P., Vestergaard, Bente, Hamelryck, Thomas Wim, Gesteland, Nyborg, J. & Atking, J., 2006, I: Biology Direct. 13, s. 1-28 28 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    Graphical models and directional statistics capture protein structure

    Boomsma, Wouter, Kent, J. T., Mardia, K. V., Taylor, C. C. & Hamelryck, Thomas Wim, 2006, Interdisciplinary Statistics and Bioinformatics. Barber, S., Baxter, P. D., Mardia, K. V. & Walls, R. E. (red.). Leeds University Press, s. 91-94 4 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Protein structure prediction using tabu search and half-sphere exposure measure

    Paluszewski, M., Hamelryck, Thomas Wim & Winter, Pawel, 2006.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  8. Udgivet

    Reconstructing protein structure from solvent exposure using tabu search

    Paluszewski, M., Hamelryck, Thomas Wim & Winter, Pawel, 2006, I: Algorithms for Molecular Biology. 1, s. 14

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Sampling Realistic Protein Conformations Using Local Structural Bias

    Hamelryck, Thomas Wim, Kent, J. T. & Krogh, Anders, 2006, I: PLoS ONE. 2, 9, s. e131

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. 2007
  11. Udgivet

    An evolutionary method for learning HMM structure: prediction of protein secondary structure.

    Won, K., Hamelryck, Thomas Wim, Prügel-Bennett, A. & Krogh, Anders, 2007, I: BMC Bioinformatics. 8, s. 357

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Bioinformatic and experimental analysis of the secondary structure of amelogenin

    Vilhjalmsson, B., Rasmussen, Anne, Fabi, B., van de Weert, Marco, Hamelryck, Thomas Wim & Lemoult, S., 1 nov. 2007, I: European Cells and Materials. 14, SUPPL.2, 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. 2008
  14. Udgivet

    A generative, probabilistic model of local protein structure

    Boomsma, Wouter, Mardia, K. V., Taylor, C. C., Ferkinghoff-Borg, J., Krogh, Anders & Hamelryck, Thomas Wim, 2008, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 105, 26, s. 8932-8937 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. 2009
  16. Udgivet

    A probabilistic approach to protein structure prediction: PHAISTOS in CASP8

    Borg, M., Boomsma, Wouter, Ferkinghoff-Borg, J., Frellsen, J., Harder, T. P., Mardia, K., Røgen, P., Stovgaard, K. & Hamelryck, Thomas Wim, 2009, LASR 2009 — Statistical Tools for Challenges in Bioinformatics. Proceedings. Gusnanto, A., Mardia, K. V. & Fallaize, C. J. (red.). University of Leeds, s. 65-70 6 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    A probabilistic approach to protein structureprediction: PHAISTOS in CASP8

    Borg, M., Boomsma, Wouter, Ferkinghoff-Borg, J., Frellsen, J., Harder, T. P., Mardia, K. V., Røgen, P., Stovgaard, K. & Hamelryck, Thomas Wim, 2009, I: School of Mathematics. s. 65-70

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    A probabilistic model of RNA conformational space

    Frellsen, J., Moltke, Ida, Thiim, M., Mardia, K. V., Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2009, I: PLoS Computational Biology. 5, 6, s. e1000406

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Biopython: freely available Python tools for computational molecular biology and bioinformatics

    Cock, P. J. A., Antao, T., Chang, J. T., Chapman, B. A., Cox, C. J., Dalke, A., Friedberg, I., Hamelryck, Thomas Wim, Kauff, F., Wilczynski, B. & de Hoon, M. J. L., 2009, I: Bioinformatics. 25, 11, s. 1422-3 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Probabilistic models and machine learning in structural bioinformatics

    Hamelryck, Thomas Wim, 2009, I: Statistical Methods in Medical Research. 18, 5, s. 505-26 21 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. 2010
  22. Udgivet

    Mocapy++ - a toolkit for inference and learning in dynamic Bayesian networks

    Paluszewski, M. & Hamelryck, Thomas Wim, 2010, I: BMC Bioinformatics. 11, Suppl 1, 6 s., 126.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    Potentials of mean force for protein structure prediction vindicated, formalized and generalized

    Hamelryck, Thomas Wim, Borg, M., Paluszewski, M., Paulsen, J., Frellsen, J., Andreetta, C., Boomsma, Wouter, Bottaro, S. & Ferkinghoff-Borg, J., 2010, I: PLoS ONE. 5, 11, 11 s., e13714.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    Beyond rotamers: a generative, probabilistic model of side chains in proteins

    Harder, T., Boomsma, Wouter, Paluszewski, M., Frellsen, J., Johansson, Kristoffer Enøe & Hamelryck, Thomas Wim, 1 jan. 2010, I: B M C Bioinformatics. 11, s. 306

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Calculation of accurate small angle X-ray scattering curves from coarse-grained protein models

    Stovgaard, K., Andreetta, C., Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 1 jan. 2010, I: B M C Bioinformatics. 11, s. 429

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. 2011
  27. Udgivet

    A statistical view on the reference ratio method

    Mardia, K., Frellsen, J., Borg, M., Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2011. 6 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Paper › Forskning

  28. Udgivet

    Efficient, non-disruptive local moves for Monte Carlo sampling of proteins

    Bottaro, S., Boomsma, Wouter, Johansson, Kristoffer Enøe, Andreetta, C., Hamelryck, Thomas Wim & Ferkinghoff-Borg, J., 2011, Next Generation Statistics in Biosciences: Proceedings of the 30th Leeds Annual Statistical Research (LASR) Workshop. Mardia, K. V., Gusnanto, A., Riley, A. D. & Voss, J. (red.). University of Leeds, s. 127 1 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning

  29. Udgivet

    Generative probabilistic models extend the scope of inferential structure determination

    Olsson, S., Boomsma, Wouter, Frellsen, J., Bottaro, S., Harder, T. P., Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2011, I: Journal of Magnetic Resonance. 213, 1, s. 182-186 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Iterative ratio method: a formal justification for the potentials of mean force

    Valentin, J., Andreetta, C., Paluszewski, M., Borg, M., Frellsen, J., Paulsen, J., Boomsma, Wouter, Bottaro, S., Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2011. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  31. 2012
  32. Udgivet

    An Overview of Bayesian Inference and Graphical Models

    Hamelryck, Thomas Wim, 2012, Bayesian Methods in Structural Bioinformatics. Hamelryck, T., Mardia, K. & Ferkinghoff-Borg, J. (red.). Springer, s. 3-48 46 s. (Statistics for Biology and Health, Springer).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  33. Udgivet

    An efficient null model for conformational fluctuations in proteins

    Harder, T. P., Bottaro, S., Boomsma, Wouter, Olsson, S., Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2012, I: Structure. 20, 6, s. 1028-1039 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 5765