Thomas Wim Hamelryck

Thomas Wim Hamelryck

Professor

ORCID: 0000-0003-2917-3602

Udgivelsesår:
Alle
1 - 25 ud af 62Pr. side: 25
Sortering: Titel
  1. Udgivet

    A Generative Angular Model of Protein Structure Evolution

    Golden, M., Garcia-Portugues, E., Sørensen, Michael, Mardia, K. V., Hamelryck, Thomas Wim & Hein, J., aug. 2017, I: Molecular Biology and Evolution. 34, 8, s. 2085-2100

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  2. Udgivet

    A Probabilistic Programming Approach to Protein Structure Superposition

    Sanz Moreta, Lys, Al-Sibahi, A. S., Theobald, D., Bullock, W., Rommes, B. N., Manoukian, Andreas & Hamelryck, Thomas Wim, 2019, 2019 IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology, CIBCB 2019. Baruzzo, G., Daberdaku, S., Di Camillo, B., Furini, S., Giordano, E. D. & Nicosia, G. (red.). IEEE, 5 s. 8791469

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    A community proposal to integrate structural bioinformatics activities in ELIXIR (3D-Bioinfo Community) [version 1; peer review: 1 approved, 3 approved with reservations]

    Orengo, C., Velankar, S., Wodak, S., Zoete, V., Bonvin, A. M. J. J., Elofsson, A., Feenstra, K. A., Gerloff, D. L., Hamelryck, T., Hancock, J. M., Helmer-Citterich, M., Hospital, A., Orozco, M., Perrakis, A., Rarey, M., Soares, C., Sussman, J. L., Thornton, J. M., Tuffery, P., Tusnady, G. & 3 flere, Wierenga, R., Salminen, T. & Schneider, B., 2020, I: F1000Research. 9, 27 s., 278.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    A generative, probabilistic model of local protein structure

    Boomsma, Wouter, Mardia, K. V., Taylor, C. C., Ferkinghoff-Borg, J., Krogh, Anders & Hamelryck, Thomas Wim, 2008, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 105, 26, s. 8932-8937 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    A probabilistic approach to protein structure prediction: PHAISTOS in CASP8

    Borg, M., Boomsma, Wouter, Ferkinghoff-Borg, J., Frellsen, J., Harder, T. P., Mardia, K., Røgen, P., Stovgaard, K. & Hamelryck, Thomas Wim, 2009, LASR 2009 — Statistical Tools for Challenges in Bioinformatics. Proceedings. Gusnanto, A., Mardia, K. V. & Fallaize, C. J. (red.). University of Leeds, s. 65-70 6 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    A probabilistic approach to protein structureprediction: PHAISTOS in CASP8

    Borg, M., Boomsma, Wouter, Ferkinghoff-Borg, J., Frellsen, J., Harder, T. P., Mardia, K. V., Røgen, P., Stovgaard, K. & Hamelryck, Thomas Wim, 2009, I: School of Mathematics. s. 65-70

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    A probabilistic model of RNA conformational space

    Frellsen, J., Moltke, Ida, Thiim, M., Mardia, K. V., Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2009, I: PLoS Computational Biology. 5, 6, s. e1000406

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    A simple probabilistic model of multibody interactions in proteins

    Johansson, Kristoffer Enøe & Hamelryck, Thomas Wim, 2013, I: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 81, 8, s. 1340-1350 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    A statistical view on the reference ratio method

    Mardia, K., Frellsen, J., Borg, M., Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2011. 6 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Paper › Forskning

  10. Udgivet

    AI Implementation and Capability Development in Manufacturing: An Action Research Case

    Eklöf, Jon, Snis, U. L., Hamelryck, Thomas Wim, Grima, A. & Rønning, Ola, 2024, Proceedings of the 57th Hawaii International Conference on System Sciences - HICSS 2024. Hawaii International Conference on System Sciences, 10 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  11. Accepteret/In press

    Abstraction, mimesis and the evolution of deep learning

    Eklöf, Jon, Hamelryck, Thomas Wim, Last, C., Grima, A. & Snis, U. L., 2024, (Accepteret/In press) I: AI and Society. 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    An Overview of Bayesian Inference and Graphical Models

    Hamelryck, Thomas Wim, 2012, Bayesian Methods in Structural Bioinformatics. Hamelryck, T., Mardia, K. & Ferkinghoff-Borg, J. (red.). Springer, s. 3-48 46 s. (Statistics for Biology and Health, Springer).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    An efficient null model for conformational fluctuations in proteins

    Harder, T. P., Bottaro, S., Boomsma, Wouter, Olsson, S., Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2012, I: Structure. 20, 6, s. 1028-1039 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    An evolutionary method for learning HMM structure: prediction of protein secondary structure.

    Won, K., Hamelryck, Thomas Wim, Prügel-Bennett, A. & Krogh, Anders, 2007, I: BMC Bioinformatics. 8, s. 357

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Bayesian inference of protein ensembles from SAXS data

    Antonov, L. D., Olsson, S., Boomsma, Wouter & Hamelryck, Thomas Wim, 2016, I: Physical Chemistry Chemical Physics. 18, 8, s. 5832-5838 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Bayesian inference of protein structure from chemical shift data

    Bratholm, L. A., Christensen, A. S., Hamelryck, Thomas Wim & Jensen, Jan Halborg, 2015, I: PeerJ. 3, 19 s., e861.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Bayesian methods in structural bioinformatics

    Hamelryck, Thomas Wim (red.), Mardia, K. (red.) & Ferkinghoff-Borg, J. (red.), 2012, Springer. 377 s. (Statistics for Biology and Health).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    Bayesian protein superposition using Hamiltonian Monte Carlo

    Sanz Moreta, Lys, Al-Sibahi, A. S. & Hamelryck, Thomas Wim, okt. 2020, Proceedings - IEEE 20th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering, BIBE 2020. IEEE, s. 1-11 9288019

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Beyond rotamers: a generative, probabilistic model of side chains in proteins

    Harder, T., Boomsma, Wouter, Paluszewski, M., Frellsen, J., Johansson, Kristoffer Enøe & Hamelryck, Thomas Wim, 1 jan. 2010, I: B M C Bioinformatics. 11, s. 306

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Bioinformatic and experimental analysis of the secondary structure of amelogenin

    Vilhjalmsson, B., Rasmussen, Anne, Fabi, B., van de Weert, Marco, Hamelryck, Thomas Wim & Lemoult, S., 1 nov. 2007, I: European Cells and Materials. 14, SUPPL.2, 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Biopython: freely available Python tools for computational molecular biology and bioinformatics

    Cock, P. J. A., Antao, T., Chang, J. T., Chapman, B. A., Cox, C. J., Dalke, A., Friedberg, I., Hamelryck, Thomas Wim, Kauff, F., Wilczynski, B. & de Hoon, M. J. L., 2009, I: Bioinformatics. 25, 11, s. 1422-3 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    Calculation of accurate small angle X-ray scattering curves from coarse-grained protein models

    Stovgaard, K., Andreetta, C., Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 1 jan. 2010, I: B M C Bioinformatics. 11, s. 429

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    Combining the multicanonical ensemble with generative probabilistic models of local biomolecular structure

    Frellsen, J., Hamelryck, Thomas Wim & Ferkinghoff-Borg, J., 2013, Proceedings of the 59th World Statistics Congress of the International Statistical Institute, 2013 . Hague, s. 139-144 6 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning

  24. Udgivet

    Computational redesign of thioredoxin is hypersensitive towards minor conformational changes in the backbone template

    Johansson, Kristoffer Enøe, Johansen, Nicolai Tidemand, Christensen, S., Horowitz, S., Bardwell, J. C. A., Olsen, Johan Gotthardt, Willemoës, Martin, Lindorff-Larsen, Kresten, Ferkinghoff-Borg, J., Hamelryck, Thomas Wim & Winther, Jakob R., 2016, I: Journal of Molecular Biology. 428, 21, s. 4361-4377 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Diverse bacterial genomes encode an operon of two genes, one of which is a unusual class-I release factor that potentially recognizes atypical mRNA signals other than normal stop codons

    Baranov, P., Vestergaard, Bente, Hamelryck, Thomas Wim, Gesteland, Nyborg, J. & Atking, J., 2006, I: Biology Direct. 13, s. 1-28 28 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 5765